EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36786 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:60246954-60248080 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PHOX2AMA0713.1chr4:60247233-60247244TAATTTAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:60247233-60247244TAATTTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:60247233-60247244TAATTTAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:60247233-60247244TAATTTAATTA-6.62
TCF7L2MA0523.1chr4:60247313-60247327GGAGATCAAAGAAA-6.21
Enhancer Sequence
CTCAATTAAG GAGATTTGAC TCCTGGGTCT TTGAAGACTA AGGTGTTATC TATGTGCCTG 60
GGTTTACCTG TGGCTATGTG TCCGTGTAAT GCTCCGAACA ATGGTAATCA ACTTTTATAA 120
TTGTGTTGCA AAATTTTTGT CCAGTTATAC CAGGGAGCCA GCATAAGAAT GTGAACATGA 180
GGTGTGTTCC GGCTCAAATT GATTCCATAT AATATCTTTT ACGGAGCATG TTAAGGTGCA 240
ATGTTCAAAG CTGGATCCTG TAAAATGCAT TTTCATGGTT AATTTAATTA TCACACTCTA 300
TACTCCTGTT TGTAGTTCAA ACTGCAGCTA TACAGGGGAT AGCAGAGTTT TCTACTTTTG 360
GAGATCAAAG AAACAAATAT CATGAATTTC AACATAGTTT ATTCCATTTT CATACAGGAC 420
ATGTGGTTTA ACATGTGTAT AGTATAAAAA CAAATTTAAA AATGCCACCA GGATTCGTGA 480
CAATAGAGTC TGTTGCTATT GATCTTTGCA GGAACAATGC AGTAAAGTTC TTTATCGCCT 540
CTAGGTAACC AGGGTTTTAG TCCCATTGCT ATTAAGCAAT TTGGGAAGAT TTTAACTATG 600
AGATCTTTCA TGTCTCTGTT TAATTTAACA TATAAATTTA CATCTTTGTT GAAGAAAGAT 660
GTTTTGTGAA ATCACATAGC CTCCTAGAAT GCTGAATCCA TTGATAAGAT CAGCTGTGGA 720
TAATTGTTAT TCTGATGACT GATCAAAGAC TTTTTCAGAA GACTCACTGC AGGAGGTGAG 780
GGATTTGCCT CACAGGGGTT CTTGCTTTGA TATGCAAGAT GGGAGACTTT TGGCCTCTCA 840
GGTTATGGCC TAACCTTTTG TTGCCCTCAT TTGTATTTGT TTGATGTGGA CCGGATCTGG 900
AGTGTTCTTT GTTATTGGTC CGCCTAAAAT GAGAAAACAA GCAGAGAGAA CCATTTTTAG 960
AATTTTCATC AGTTTCAAAT TCAATCATGT TGAATTAATG TTGATGCATC ATCTTGCAAT 1020
ATTAATTCTG GAAGCCACAT GATGTTGCTG GTCAGATCTG AATAGCTGTT GTTGATTTCA 1080
GCATATTGTG AGTGTGTAAC ACCTTTTTAC ACAGTCTGCT GTATTC 1126