EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36688 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:58008584-58010438 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr4:58009039-58009053TTTGTTTACGATGG+6.19
FOXF2MA0030.1chr4:58009039-58009053TTTGTTTACGATGG-6.19
IRF1MA0050.2chr4:58010012-58010033AATGCGAAAGTGAAAGCATGC-6.85
IRF2MA0051.1chr4:58010016-58010034CGAAAGTGAAAGCATGCT+6.44
SOX10MA0442.2chr4:58009474-58009485AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr4:58009474-58009485AAAACAAAGCA-6.02
SP1MA0079.4chr4:58009110-58009125TAAGCCACGCCCAAA+6.1
SP1MA0079.4chr4:58009110-58009125TAAGCCACGCCCAAA-6.1
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ZNF384MA1125.1chr4:58009455-58009467AAAAAAAAAAAA-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:58009453-58009465ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr4:58009466-58009478ATAAAAAAAAAA+6.27
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ZNF384MA1125.1chr4:58009466-58009478ATAAAAAAAAAA-6.27
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ZNF384MA1125.1chr4:58009465-58009477AATAAAAAAAAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr4:58009465-58009477AATAAAAAAAAA-6.62
ZNF384MA1125.1chr4:58009452-58009464TATAAAAAAAAA+6.92
ZNF384MA1125.1chr4:58009452-58009464TATAAAAAAAAA-6.92
Enhancer Sequence
ACATAAATGA CTCGGACTTT GACTAGGACT TGCCCCTATT GACTTGTAAA GACTTGCTGC 60
TTCCCATGAA AAGCCCAACG ATAAAAAAGT ATGTTGACAT AGACCGCTCT CTCTCTCTCT 120
CTCTCCGTTT ATGTGTGCGT GTGTGTGACG GCACGCGCGC GCGTGTGTGT GAGCATGCGC 180
GCTTTCGGCA TGACGTCCAA TCAAAGCATG GTAGATTGTT TTGATTCGAC AGTATCCAAC 240
GTGACTACTA TGAGGCGCGG GAGTGGACAA AAGTCAAGCG AACGCAGAGA GAATTTGAAT 300
TTGAACTTGA GATCGAGCCA ATACTCGCGT GCCAATACTC GCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 360
TCTCTCTTAC ATACAACATA CACCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 420
TCTCGTGCAT TCAGTCTCTT TGCGTTCGCT TGACTTTTGT TTACGATGGC GTCTCATACC 480
TTTAGTGCTT TTGCTCTCAC GGGATCCTGT TAAACTGACC CTTCGCTAAG CCACGCCCAA 540
AAACCGCCAC CCACCAATCG CGGCTTACCA ATCGTAGCTA CGGGCAGAGG CTCTGTCAAG 600
CTTTCGAGCG AGGGAAACAA GCCAAATCGT TGCGCAATTG GATTGTGAAA ATCTGACACC 660
TGCTATCCTA AAAGTTTGGA CTGGGTGGTG GGATTTTTTC CCTTTTCAAA ACCAAAGCCC 720
AAGAGGAGAA ATGCCAGCGT GGATCAAGCT GTGTGAGGGG CGGCAAAGGA GTTAAGCTAA 780
GTTGGTTTTG TTTTCGATAT TCACATTCAG TGATAGGTGG CAATAACTCA CACTCCTCTT 840
ATCCTAAACA GATCTAAACT GTGTTTCTTA TAAAAAAAAA AAATAAAAAA AAAACAAAGC 900
AGGTTATGCT TCCCAGCGGT CTTTTTCTTT TTTTCCCACT CGATATTATG AGCCAGGGCT 960
CGACAATAAG GACTGCCCGA TGGCCCGGGG CCAGCGTGCG AGACATTCGG GCCAGTGTAC 1020
AAAATGTTAC TGGCTCGATC GGGCCAGCTG CTGCCTTTTT GCCTGCCAGA TCGAGCCAGA 1080
GCTGCGTGCT GCGACTGTCT GTCAATTGTG TGCAAATACA ATCTTACGGT GCTTTCACAC 1140
ATAGACGTTT GTTTCGGAAT CTGTCTCGTT TCCCCCGTTA GCGTGTTTTT TTTTGGCATA 1200
TATCCAGCAG TTGCGCTCGC TTCCGCGCCA AATCAATTAG TCCAAGATCG CCTGAATGAG 1260
ACGCGGTCTC TGTCCTATTG AGCGTATCGA TTGTAGCGAG AAAACAAAAC AATGCAACGA 1320
ACTAACGACC CAGGCTATAT CACAGTGTAC TATGATCGTG TAATAGCCAT ATATACGGCT 1380
ATATGAAGAG AGAATGATGA GCTGGGCCAG ATGTCATTCT TACCGGTAAA TGCGAAAGTG 1440
AAAGCATGCT GAAATATTAC CGAGAGCTGT TTATCCAGCC TGATCTCGGT TTATCCGTCA 1500
GGAAAATTGA CCGAAATTAC TATCTGTTAA TTTTTCCATA TTTTAATCGT ATAAAATGTT 1560
GTATTAGGCC TGTTGTTTTG TTCATTTCCG CACTGACAGC TCGAAAGAAA GATTTACATT 1620
GATCTGATGC AGTATCGGTT CATCTGCTAT GTCTCTCTAT AATTTAAGCC TAAAATACAG 1680
AATTATAGTC AACGTTTCTT TAATAGATTG ATTAATTCAA TTGATCGATT TCTACAAAAC 1740
CTGACAATTG AAATGAGGCT CTGTATATAT GAGAAAGTCT GACCTCGATT TGTATTCGGT 1800
GACGATGTCT GTGGGTTGTT AAATTAAAGT GCACATTTTC ACTTATAAAA TATT 1854