EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36593 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:55641444-55642714 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:55641943-55641960TGAACTAATTAATTAGG+6.16
FOXP1MA0481.2chr4:55642335-55642347TACTGTTTACAT-6.11
Foxj3MA0851.1chr4:55642684-55642701ATATTTGTTTACCTTTT-6.93
Lhx3MA0135.1chr4:55641945-55641958AACTAATTAATTA-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642697-55642709TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642698-55642710TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642699-55642711TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642700-55642712TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642701-55642713TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55642702-55642714TTTTTTTTTTTT-6.22
mix-aMA0621.1chr4:55641949-55641960AATTAATTAGG+6.32
mix-aMA0621.1chr4:55641946-55641957ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TACATAGACA GGAACTTATT GTATATCTGG CAATACATTT GTCATGCCAA AAACAAAACA 60
AAACAATGAT TGAATTGAAA AGGGAAAAAC GTGGAGAAAA GGGAGACGTG CCAAATAATA 120
CACAGGGATG GATGAATATG TGTCTATTAA GATAAATATG TAAAGTTCCA TTATTTGTCT 180
GTCTGTTAAG CAGCACTTTA ACTACTTTTG TGGTTTATGT GCTGCTTTCC TAAGGTTACA 240
TTAGGCTAAA TTCTTATCAC AGAATGAGAA ATAAAATGTA CAAAATGAGA ATACTATGAA 300
AATGCTTTTA CTACATCTTA TATAACGGGT TAAGTTTTTA CTGTCATCTG TTTGCGTTGC 360
TTAGCAACGC TAGTAAACAA AGGAAAGACG GCGTGCATGT AAATATCTAC GTGCGATCCG 420
CTAGGCCACG GATTCTCAAT CCTGTTCTTG GAGATCCACC TTCCTGCAGA TTTCAGTTGG 480
TACCCATATC AAACACACCT GAACTAATTA ATTAGGACCT GCACACCACT TGATAATTAC 540
AGGCAGATGT GTTTGATATG GGTACCAACT GAAATCTGCA GGAAGGTAGA TCTCCAGGAA 600
CAGGATTGAG CACCCCTGCG CTAGGCCAAA GGCCTTTATG TATGGCGCCC TCTGGTTTCC 660
CGTATGAATG AAATGGGCAT GAAGCTCTAA GTTCATCGCC TCAGTATGGG TAAAAATGGT 720
AAAATATCAA GTAAAGACAT GAGAATCCAT CAATATTTCA TCAAATCTGG AGACTAACAG 780
AAAAAATGCA TACTTTTGGG ATAAAAGTCA AGAGTTTATT TAGTGACAAA CGACTGCATT 840
TCTTTATAAA GCATATAACG TTAAGGGGTC AAACGTTACA AACTGAATTA ATACTGTTTA 900
CATGGCAAAA TAACGAACAG GAGGTATAAA ATGCGAGTAA ATTAGACTGA GGACAAAATT 960
CGTCACACAC CATCCGGTAT AGTTCCCTCA CAAGACTAAT TTAATAGTAA TGCTTAATAA 1020
CGATTTATTC GTTTCTCAAA AACAATTAGT TCATAATATA TCTGTCTGAA TATAGCCAAT 1080
TTAAGCACTC GTACGCATTT TTTTTAACAT TTAATTGAAA ATTTACCTCA GAAATCGTTC 1140
CTAATGCGAG ACCCAATGTG CGGACCATCG GACCGGATGA TTAAGGACAG GTTATGGAAA 1200
ATCCCAGCGG TCTCATTGGC CAGCTCTTAT GTTTACGTTA ATATTTGTTT ACCTTTTTTT 1260
TTTTTTTTTT 1270