EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36558 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:54230854-54231807 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF3MA0605.2chr4:54230932-54230944CGTGACGTCATC-6.02
DMRT3MA0610.1chr4:54230854-54230865AATGTATCAAT+6.62
DMRTA2MA1478.1chr4:54230854-54230866AATGTATCAATA-6.02
DMRTC2MA1479.1chr4:54230854-54230866AATGTATCAATA-6.52
FOXE1MA1487.1chr4:54231727-54231742TATAAAATAAACAAA+6.15
Foxj3MA0851.1chr4:54231728-54231745ATAAAATAAACAAAAAC+6.62
JDP2(var.2)MA0656.1chr4:54230932-54230944CGTGACGTCATC-6.22
JUNB(var.2)MA1140.2chr4:54230932-54230944CGTGACGTCATC-6.14
MEOX2MA0706.1chr4:54231227-54231237GTTAATTACT-6.02
Enhancer Sequence
AATGTATCAA TAAGTCATGA CTGCAACAGA TAGTGGCAAA AAAAGTTAAA CAAAAAAGAC 60
TTTTATTTTG CCGTGGCGCG TGACGTCATC AGGTAGCGCT GCTTCGTCGC TGTGATTCAA 120
CTGGAGAAAG GTTTGTTTTA AACGTTTACA GATCTAAACT GATTTAAAGT TAAAGTTCTA 180
AAGTTTTAAG TTTTTTATAC GATGCTATAT TATGTTTCTG CTGTTGGAAA TATTATTTTA 240
ACCCTTTATA TAACTATTTT AGTATTTTAG TAGTACTATT TTATTCTCAG TAACTGAAGG 300
CTGTTGTTTG AATAAAACAA CAGAAAAGTG TATAATAAGT GTTTAAATTA AATGTTTCAC 360
CTAATTTCTT TTTGTTAATT ACTCTCAAAT AAAGAAACCA TTGAAGCAAG TGTTGAAGAG 420
AAATTATTTT GTTTCTGTTC ATTGTTTTGT TCATTTTGAA CTGGATTAAG TGTCCAAACA 480
CAGAGAAAAA AAAACCCTGC TGAAGCGACT GATCTCCACA CTATTGTAAA GATGGCATTT 540
ATTAAAGAGG AGAGTGAAGA TTGAAGAGAC ATTCACAGTC AAACAGGAAG ATCTGCAGGA 600
ACAAACAGGT TGGTTTTCAT ACTGTTATAT TTTAATATTA AGAATAGGCT ACTAAATTAA 660
ATCCATCTTG CAGCCCTGAG TGTGCTGCCT AGTTCTCCTA AACGCACAAA AGCAGTCATT 720
GAAAGACAGG AATGAGTTTC TTTTGTCACT TGTTCTCGTG TCTTTTGTCA TTCTTTTAAT 780
GTATTATTAG TCTCCTATTT TCTCTTCCTT TTTAAGGTTA TTGTTTTTCT TGTTCTCCTG 840
CTGTTGGTAA AGCGTCTTTG AGCACTGGCG CTATATAAAA TAAACAAAAA CAATAAATTA 900
AAGTTCAAAT GAGCTGACGA TATTTTACCT ACAGTATTCT CATAGAAGAT ATC 953