EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36557 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:54226277-54227524 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2MA1469.1chr4:54226497-54226516TAATTATGAGTCATGACTT-6.18
BACH2MA1469.1chr4:54226497-54226516TAATTATGAGTCATGACTT+6.29
Foxd3MA0041.1chr4:54226689-54226701AAACAAACAAAC-6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr4:54227365-54227380AAGTTCAAAGTTCAA+6.23
HNF4GMA0484.1chr4:54227364-54227379AAAGTTCAAAGTTCA+7.73
Hnf4aMA0114.3chr4:54227365-54227381AAGTTCAAAGTTCAAT+6.76
ONECUT1MA0679.1chr4:54226663-54226677ATAAAATCAATATT+6.3
ONECUT2MA0756.1chr4:54226663-54226677ATAAAATCAATATT+6.18
ONECUT3MA0757.1chr4:54226663-54226677ATAAAATCAATATT+6.37
RXRBMA0855.1chr4:54227365-54227379AAGTTCAAAGTTCA+6.32
RXRGMA0856.1chr4:54227365-54227379AAGTTCAAAGTTCA+6.54
RxraMA0512.2chr4:54227365-54227379AAGTTCAAAGTTCA+6.4
Enhancer Sequence
TGTATAAAGG GTTAAAATAA TATTGTCAAC AGCAGGTACA TCTAACATTA AATGAACACA 60
CTGAAATTTT AATCAGTTGG TTTACATCTG TGTACAAGCT TTAAAACAAA CCTTTCTCCA 120
GTTGAATCAC AGTGTGGGAG CGGCGCAGCC TTATGACGTC ACACCACCAC GCCACAATAA 180
AAGTCTTTTT TTTGTTTAGC TTTTTCCCCC TACTCACTCT TAATTATGAG TCATGACTTA 240
TCGATACATT TCTCCCTCAT TTTCCACTTT ATAATTTATC TGCTTTTTGT TTTGTATTTG 300
TAATGAATGG GGAAACATCA AATTTTTATA TAAATTTATA TACGTAATAG GTTGAAACTT 360
ATTTGGGCTA CAGTCCATTT GTCAGGATAA AATCAATATT TATAACCAAA CCAAACAAAC 420
AAACACATAA CTAAATAGTT GTAAAAAAGC TTTTAAAAAT GACTGAAAAA CTTAATACAC 480
TGTTGAACAA TGCATGCACA TGTTTAGATT TTACATTTTA TAATGTTAGC ATTCAGATAT 540
TATTTGAGTG TAAATTCAGA ATGTGCAACT CACCTTTCCA GTCTTCAATG AAGAAGTGGG 600
ATGAGAAATG GCCTCAGTCG GTTTTTCTTT GTATGTTGTT GTTGGTAATA ATCTCAATGT 660
AGGAACCAAC AATCGTAGTT TGTCCTCCAA AGTTGTTCTC TTATAGCTAA ATAAGCCAAT 720
GAAGTTTCTG TTAAGAACGC AGAATTTATA GATACAACCC TGCTGACCTA CTTGATCTGG 780
CATTTGATTG GTTAATACTC AATTGGCCCC CATTAATGCT GGTATAAAGA TGCAAATGAG 840
CAGTGGGCAA CAGTGAAGAC TCAAAACACA TTACTGCAGA GGATGGGAAG TTTAGCAGCT 900
ATACGAACCA TAGCTTTAAA GAGAAATAAA GATGTATTGG GAAAATAAGT TGACTTTTGA 960
TGGAAGCTTT TTTATTTTGG CTGCTGCATT TTATAGTTAA ATGGGTGGTC CACTGCAATA 1020
TCATATTTTA AACTTTAGTT GATGTGTAAT TTAGCTGTGT GAAAATAAAC AACATCTCTG 1080
AATGTAAAAA GTTCAAAGTT CAATGCAAAG TGAGACCTTA AACAGCCGAA ATACAGAACT 1140
TGATTTTAAC TTGCACTGGG AAAAAAATGT TTTAGAAAAA GCCACAATAA AAAAAGCAAA 1200
CAGCAGTTTA CACCGGGGGA AAAAAGTTTT CATTATTAAA AATAAAA 1247