EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-36273 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:47904778-47906234 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:47906001-47906012AAGCAATAAAA+6.32
DMRT3MA0610.1chr4:47905662-47905673ATTGATACATT-6.62
DMRTA2MA1478.1chr4:47905661-47905673TATTGATACATT+6.02
DMRTC2MA1479.1chr4:47905661-47905673TATTGATACATT+6.52
HNF1AMA0046.2chr4:47905986-47906001TGTTAAAAATTAACA+6.05
MEOX2MA0706.1chr4:47905059-47905069AGTAATTAAC+6.02
Six3MA0631.1chr4:47905366-47905383AAAAGGGTATCATATCT+7.08
ZNF384MA1125.1chr4:47905620-47905632TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:47905621-47905633TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:47905622-47905634TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr4:47905623-47905635TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr4:47905624-47905636TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
ATATCTGAAT GAGGATTAAA TGACCGAGTT GGTCTTTGAG AATGAAAACC AACCTGTTTG 60
TTCCTGCAGA TCTTCCTGTT TGACTGTGAA TGTTTCTCCA ATCTTCACAT CTTCACTCTC 120
CTCTTTAATA AACGCCATCT TTATAACAGT GTGGAGATCA GTCGCTTCAG CAGGAGTTTT 180
TCTCTGTGTT TGGACACTTT ATCCTGTTTA AAATAGACAA AAAAAATGAA CAGAAACAAA 240
ATAACTTCTT AACACTTACT TCAACAGTTT CTTTATATAA GAGTAATTAA CAAAAAATAA 300
ATCAGGAAAG TCTGAGCAAG AAACAATAGC CACAAATGAC CTGATTAAAA CTAGTAACAT 360
TACTTCATTT CTTATATATA GTGATGTATA CTTAGAATGG AACGACATTA TACTGTTTAA 420
TAAATTAAAC CTTCAATAAG GAAACTTATT ACTCACATCT CTGTAACTTT TTAAACTTTA 480
TTCTTTATGT ATGTTCTTAA TCGTTTTGTT TGTTTTATTT AGCTTATTGT CTGCTTACAG 540
CAATGTGTAG CACTTTTTTT GCACAAGACA AATTTCCTCT CAGGGACAAA AAGGGTATCA 600
TATCTTTATT CAAACAATAG TACTATTTTA CTCACAGTAA TAAGGCCTAT GTTGTATAAA 660
GGGTAAAATA ATATTATCAA CAGCAGGTAC ATAATTTAGC ACTGAATGAC AAAAAAAACA 720
GAAACTTTAA TCAATCAGTT TATAGAAGTG TAAACGCTTT AAAACAAACC TTTCTCCAGT 780
TGAATCACAG CGCTGGAACG GCGCAGGCTT ATGACGTCAC ACGTCACGCC AAAATAAAAG 840
TCTTTTTTTT TTTTTAAATC TTTGCCACTT ACTGTTGCAG TCTTATTGAT ACATTTCTGC 900
CTCGTTTCCA TTTTTTTCTC ACAGACGCAC ATATATTCAG TATTTGGAGT TGATCAAAAC 960
CTTTACTCTA AACATTTTAA GACAATTAAA AAAACGTTTA ATCCACTAAG ACTGTTTAAA 1020
GCAGAAATCT TAACATTCTA AACGATATAA CAAATAATCT AATGAGTGTT TGGAGCTGAA 1080
ACTTTACAGA AAAAAAGGTA AAATAGGTGT CCTTCATGTA TAAAGTATTC ATTACTACTA 1140
CACGTTTTAG TTCTTCTAAC TAGTCATGAC TTATATATAG TTTTTCTCTG CGTTTGGACA 1200
CTTTATCCTG TTAAAAATTA ACAAAGCAAT AAAAATGTAA AATGAATAAA ACAATGAACA 1260
GAAAGAAAAT AACTTCTCTT CTTCTTATAT GAGAGTTATT AACAAAAATA AATCAGATAA 1320
GTCTGAGCAA GAAACTATAG CCACAAATTA GCTGATTAAA ACTAGTAACA CAACTACATT 1380
TCTTATATAT AGTGATGTAA ACTTAGAATG GAATGACATT ATACTGTTTA ATAAATTAAA 1440
GCTTCAGTAA GACACT 1456