EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35992 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:42242846-42243586 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr4:42243041-42243052AATGTATCAAT+6.62
DMRTA2MA1478.1chr4:42243041-42243053AATGTATCAATA-6.02
DMRTC2MA1479.1chr4:42243041-42243053AATGTATCAATA-6.52
ZNF384MA1125.1chr4:42243087-42243099AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:42243088-42243100AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:42243089-42243101AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:42243090-42243102AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:42243086-42243098TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr4:42243085-42243097TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr4:42243084-42243096TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TGTAAAGTTT CAGCTCTAAA CACTCATTAG ATTATTTGTT ATACCTTTTA GAATGTTGAG 60
ATTTTTGCTT TAAACACTTA GTCTTAGTGG ATTAAAAAAG TTTTTTAATT GTCTTAAAAT 120
GTTTAGAGTA AAGGTTTTGA TCAACTCCAA ATACTGAATA TATGTGCGTC TGTGAGAAAA 180
TGGAAACGAG GGAGAAATGT ATCAATAAGT CAAGAGAGCA ACAGTAAGTG GCAAAAGGTT 240
TAAAAAAAAA AAAAAAGACT TTTATTTTGG CGTGACGTGT GACGTCATAA GCCTGCGTTG 300
TTCCAGCGTT GTGATTCAAC TGGAGAAAGG TTTGATTTAA AGCGTTTACA CTTATATAAA 360
GCGATTGATT AAAGTTTCTG TTTTTTTGTC ATTCAGTGCT AAATTATGTA CCTGCTGTTG 420
ATAATATTAT TTTACCCTTT ATACAACATA GCCCTCATTA ATGTGAGTAA AATAGTACTA 480
TTGTTTGAAT AAAGATGTGA TAACCTTTTT GTCCCTGAGA GGAAATTTGT CTAGTGCAAA 540
AAAGTGCTAC ACATTGCTTT AAGCAGACAA TAAGCTAAAT AAAACAAACA AAACGATTAA 600
GAACATACAT AAAGAATAAA GTTTAAAAAG TTACAGAGAT GTGAGTAATA AGTTTCCTTA 660
TTGAAGGTTT AATTTATTAA ACAGTATAAT GTCATTCCAT TCTAAGTATA CATCACTATA 720
AATAAGAAAT GAAGTAATGT 740