EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35980 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:41997430-41998552 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:41998369-41998380AAGCAATAAAA+6.32
HNF1AMA0046.2chr4:41998354-41998369TGTTAAAAATTAACA+6.05
MEOX2MA0706.1chr4:41998458-41998468AGTAATTAAC+6.02
Enhancer Sequence
TGAATGACAA TCAAATGACT GAGTTGGTCT TTGAGAATGA AAACCAACCT GTTTGTTCCT 60
GCAGATCTTC CTGTTTGACT GTGAATGTTT CTTCAATCTT CACATCTTCA CTCTCCTCTT 120
TAATAAACGC CATCTTTATA ACAGTGTGGA GATCAGTCGC TTCAGCAGTT TTTCTCTGTG 180
TTTGGACACT TTATCCTGCT TAAAATGAAC AAAACAATAA AAATGTTCTG TTTAAAATAA 240
ATAAAACAAT GAACAGAAAC AAAATAACTT CTCTTCAACA CTTGCTTCAA CAGTCTCTTT 300
GCATGAAAAA AAAATTAACA AAAAGAAATC AGGTAAGTCA GAGCAAGAAA CAAAAGCCAC 360
AAATGACCTG ATTAAAACTA GTCCTCCATT TCTTATAGTG ATGTATACTT AGAATGGAAT 420
GACATTATAC TATTTAATAA AGTAAACCTT CATTAAAACA CTTATTACAC ACTTTACTGT 480
TACTTCACTT AAAACTTTAT TCAGGTTTGT TATTAATTGT TTTGTTTGTT TTATTTATAT 540
TATTGTCTGC TTATAGCACT TTTCTTTTTT TGCCCAAGAC TAATTTCCTC TCGGGGACAA 600
AAAGTTTATC CTATCTTTAT TCAAACAATA GACCTCATTA CTGTGAGTTA AATAGTACTA 660
CGTTGTATAA AGGGTTAAAA TAATATTGTC AACAGCAGGG ACATAATTTA GCACTGAATG 720
AAAAAAACAA ACTTTAATCA ATCGCTTTAT ATAAGTGTAA ACGCTTTAAA ACAAACCTTT 780
CTCCAGTTGA ATCACAGCGC GGGGTCGGCG CAGGCTTATG ACGTCACAAT CCACGCCATA 840
ATAAAAGTCT TTTTAACCTT TTTTTAAGTT ACTTTTAGTC ATGACTTATT ATTTAGTTTT 900
TCTCTGCGTT TGGACTTTTT ATCCTGTTAA AAATTAACAA AGCAATAAAA ATGTTCTGTT 960
TAAAATAAAT AAAACTTTGA ACAGAAACAA AATAACTCCT CTTCAACAGT TTATTTATAT 1020
GTAAACTCAG TAATTAACAA AAATAAATCC AGTAAGTCCG AGCAAGAAAC AATAGCCACA 1080
ACTGAGCTGA TTAAAATTAG TACTGCATTT TTTATATACA GT 1122