EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35941 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:41084998-41086293 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NRF1MA0506.1chr4:41085724-41085735GCGCATGCGCA+6.32
NRF1MA0506.1chr4:41085723-41085734TGCGCATGCGC-6.32
Rhox11MA0629.1chr4:41085224-41085241ACGTCGCTGTAAAGCGC+6.51
Sox1MA0870.1chr4:41085035-41085050CACAAAAACATTGTT+6.09
Stat4MA0518.1chr4:41085976-41085990CCCTTTCTTGGAAA-6
Enhancer Sequence
GGAGAATTTT TAGGCACAGC ACGATCTGAC TTTTAAGCAC AAAAACATTG TTTATCTTTT 60
CTATTTTGTC CGGAAGAATA GATCAGAGAC AGAGAAACAA AGTTGTTGTG TTACTGTATA 120
ATTTATTGTG GTACCCAGTG TGTTTAAACG CATGAATGCG CAACTCGAGT GCTTCTGAGA 180
AAGCGAACTG CAGTAAATAG TTATTTGTCC ACGAGACAAA AACGATACGT CGCTGTAAAG 240
CGCACGGATT GAGAAACAAT AAGTGTGTTC CTTATTCTTT CTCCTATAAG GCCTTCACAG 300
TTGATTTAAA GGTGCGTGTC CCAGCTTTAA AGACTAACTG TGCATTTCTC CCTGGTCAAA 360
TTAAGCACAG GGTAGCTAAC TGTCTTTTTG CCATCTAATT CACTAGCATC AGAGTTAGTG 420
AACTCAGCGC GCCGCGCTCG AGAGAGCGGC AGAGCGTATT CTCACGGGAG AACTTATCTT 480
GATCAAGTAA AGTGTGCGTG ATTGAATCCA CGCGTGTCTT TGACTGTGAA TAGTCTTGAC 540
ACAGAGCGCT AGGATCCGCC GAGATCTTAA TAGTGCTATA TTATGTTGAG CAGTGTGAAA 600
TGCGCCGCCA TTTCATGTAA TGCATGTATG TTTGTGGGCA TAACCGCATA TTGGTTCATT 660
CTGTGTACGT CGTCATAGTA ACAGCCTCCC GAAAGTCCTG GAAGACTTTT CAGAGTACTC 720
TCAAGTGCGC ATGCGCAGTC CTCCGCGCTT GCATCGGCTG TAGACATTAG CACAAGGCTA 780
AGCTAACTGA AGCTCACGCT GTTGCAGTGA AGTGTGTGGT ATGGCTATGC CATTATAGCA 840
TTAAAGGCTA GTGTAGTAGC GCTCTTCTTG TGGTCTTGAA TGCAGTGTGT TAAGTTGAAG 900
TGACAACCTA ATTCACGCTA GCGAGATTTT GAATCTTGAT TTCTCACTCT TTATATTTGC 960
CTTATTTCTC ATTTTTCTCC CTTTCTTGGA AAAGGCTTTG ACTAATGCAG ATTTAGTAAA 1020
CCCCATTGTA CGCGATCTCA TCGCTGGTTT AATCACATTT GTCAAATGCT TTTCCTGTTT 1080
AACCTGGCCT GTTTTATTAA TTCAAATGCT CATAAGTTGT TGGTTTATTA GCAATGAATT 1140
ATAGTTTATG ACTATAACAT AATGCTTTTG ATTGCTCAAT CAAATGAATG CTTAATTAAA 1200
GATTAATGCT TTGCTCTTCT GAAACTTATC AACATTATAG GAACAACCAT TTTCTATGAC 1260
TGTTGATATT TGAAGTTGAT TTATAAGCAC AGTGT 1295