EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35917 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:40455258-40456694 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr4:40456543-40456557TATATTAATATTAG-6.21
DUX4MA0468.1chr4:40456027-40456038TGATTGGATTA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:40455661-40455673AAACAAACAAAC-6.32
GRHL2MA1105.1chr4:40456143-40456158TACAAACCAGTTTTA+6.7
Enhancer Sequence
CTTCTTACTT TTTTTCCACT TACTCTTAGT GATGACTTAT AGATACATTG CTTCCTTGTT 60
TTCCACTTTA TACTTTATTT GCTTACTGAT TTGTATTTGT AAGACCATCA CTATGTTAAT 120
TGAAAAAAAG GATTTACCCC CCACTGGATC TTTGCCTTCA GGTAGGTTGG TAAGAGGTTG 180
CATTTTCTTT AAACGATTGC ATTTCTTCAT CCATAGCTTT AACTCATTCA CTTGCATTCA 240
CTGATGTTAC CACCTCTTAG TATGTTTGAA TGGGGAAACA TCAAATTCTC CAAAATTGCC 300
TGCCAGGTTC CTACCTATAT ATAGAATGAC ATGAATAAGT GGAGGCTTAT TTGGGCTACA 360
GTCCATTTGT CAGTGGACTG TCAAGCATTA TTTATAACCA AATAAACAAA CAAACAAAAA 420
ATAAATAAAT AGTTGTAAAA AATCTTTTAA AAATGACTGA AGAACGTAAT ACAACGTTGA 480
ACAATGCATC CACGCATATT TAGATTTTAC ATTTTATAAT GTTAGCATTC AGATATTATT 540
TGAGTGTAAA TTCAGAATGT GCAACTTACC TTTCCAGTCT TCAATAAAGA AGTGGGATGA 600
AAAAATGACC TCAGTGGGTT TTTCTTTGTA GGTTGTTGTT GGTAATAATC CCAATTGTAG 660
TTTGTCCTCA AACGTTGTTC TCTTTACTTA GCAAAATAAG CCAATGAAGT TTCTGTTAGG 720
AACCCAGAAT ATATAGATAC AACCCTGTTG AGCTACAGGA TCTGGAACGT GATTGGATTA 780
GACTCAATTG GCCCCCATTA ATTCTGGTAT AAAGATGCAA ATGAGCAGTG GGGAGTAGTG 840
AAGACTCAAG ACACATACAG TGGGGGATGG GAAGTTCAGC AGCTTTACAA ACCAGTTTTA 900
CAGAGAAATA ATGATGTATT GGGAAAATAA GTTGACTTTA GCCATCATCA TTTGTTTTGT 960
TGCTGTTGTT TTATAGGACT ATTGATGGAA GCTTTTTTTA TTTTGGCTGC TACATTTTGT 1020
AGTTAATGCT GATACACCTA TGTTGAGGTA TTTTGATTTG AAACACATTT TAATTGTTTT 1080
TTTTTTCCCA AGCTGGTTTT TATTTAAAGA TGCAAATGAG CATTGAAGAC TTAAATCACA 1140
CTGATGTCTC AACACACACA ACTACATTCA CTTATATAAT AGTTATGTAA GTCTTATACT 1200
ATTATACTGT GATATATCAT TATTCGTTAA AAGAAACAAT TTCTAATCTT CACAGTGTGG 1260
TTTTATTTGT GTTAAGTTCA GTCAATATAT TAATATTAGC AATGTTTTAG TTATTTATTT 1320
ATAACTGAAC CTGTTCTTTA TGTGAGTTTA GAGTCTTTTA CTTCTCCTAA AGCACATGCA 1380
GCTCAATACT GCTTCCTGTA AACTGTCAAC ACACTCAACA GGTCAATTAT TTCTTT 1436