EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35867 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:39675701-39677064 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr4:39676647-39676658AATGTATCAAT+6.62
DMRTA2MA1478.1chr4:39676647-39676659AATGTATCAATA-6.02
DMRTC2MA1479.1chr4:39676647-39676659AATGTATCAATA-6.52
Foxd3MA0041.1chr4:39677012-39677024AAACAAACAAAC-6.32
Enhancer Sequence
GGGTTGTATC TATATATACC AGGTTCCTAA CAGAGGCTTC ATTAGCTTAT TTAGCTAAAA 60
GAGAACAACT TTTGAGGACA AACTACGATT GTTGACTTCT ACATTGCGAT TATTACCAAA 120
TACCTACAAA GAAAAGCCCA CTGAGGCCAT TTTTTCATCC CACTTCTTCA TTGAGGACTG 180
GAAACGTAAG TTGCACATGC TGAATTTACA ATCAAATAAT ATCTGAATGC TAACATTATA 240
AAATGTAAAA TCTATACATG CGTGGATGCA TTGTTCAACG TTGTATTTAG TCCAGCATAC 300
ATGAAAAAAG TACAGAAACA CAGACTTGTT CAGTTTGTAT CTGATAAAAA TTCTGAATCA 360
AAGATTCCAG TTGTAGAGGA GGATTTTGAG ATCAGGAAGT CCTGGGGTGT CTGTGAAATT 420
AGACCCAGAG TTGAGCCCAC AAAGTGCCAA GGAAGAGCTC ATTTTAGACA AACCGGTGGA 480
AGATAAACCA GAAGTTAGAA TCCTGCGAGC TTATTTAAGC GATTATGCTT GTGGTTTTGA 540
AGGTGATGTG ATCAACATAG ATTATTGTTA TTGACTTGTT TGTAATGTAC CACAAAGATA 600
CAAAGACGTG GTTACATCAG TAAATGCAAG TGAATAGGTT AAAGCTATGG TAGAAGAAAT 660
GCAATTGTTA AAAGAATGCA ACTTTTGCTC TCACCAACCT ACCTGAAGGC AAAGGTCTAG 720
TGGGTAAATG GGTTTTTGCA AAAACAATGT ATGTTGCCAA AGAGAACTAT GATAAGTCTT 780
TTCTCCAACT GCTAACATGA CTAGTGTAAG AGTGTTAATG CAAAGAAAAT CTGATTGTTC 840
ATGACATGGA TGTAAAAGCA GCATATTTAC ATGCACCAAT AGAGTGTGAC ATTTCATAAA 900
AAAGCCAGAA TGTTATGAGG TAAAATCGAA AAGAAAAGGT GTGAGAAATG TATCAATAAG 960
TCATGACTAA GCAAAACAAA AAAAAGACTT TTATTTTGGT GTGGTGTGTG ATGTCATAAG 1020
ACTGTGCCGC TACCGCACTG TGATTCAACT GGAGAAAGGT TTGTGTCAAA GCTTTTGCAC 1080
AGATAAAAAA CTGATTGATT AAAGTTTCAG GTTTTTCATT CAACGATAAA TGATGTACCT 1140
GCTGTTAACA ATATTATTTT AACCTTTTAT ACAACGTTGT TCTATCTTAA TCACAGTGAT 1200
GAGGACTATT ATTTGAATAA AGATAGGATA AACTTTATTT GTCCACTAGA GGAAATTTGT 1260
CTTGTGCAAA AAAAAGTTCT ACACATTGCT GTAAGCGGAC AATAAAATAA AAAACAAACA 1320
AACAAAACAA TTAAGAACAT ACCTGAATAA AGTTTGAATA AAG 1363