EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35653 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:33669676-33670924 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr4:33669891-33669902TATTGTGCAAT-6.62
Foxq1MA0040.1chr4:33670039-33670050TATAAACAATA-6.32
RFX1MA0509.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG-7.24
RFX1MA0509.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG+7.25
RFX2MA0600.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG-6.93
RFX2MA0600.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG+7.03
RFX3MA0798.1chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG-6.74
RFX3MA0798.1chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG+7.01
RFX4MA0799.1chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG-6.51
RFX4MA0799.1chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG+7.14
RFX5MA0510.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG-6.23
RFX5MA0510.2chr4:33670285-33670301CGTTTCCATGACAACG+6.44
Enhancer Sequence
ACAATAATAG TATATTCTGA CATAAGATTT TAATAAGACT TCAAACAATG CCCATTTTTG 60
CCAGCAAATT AAAGTTATGC GCCCTGTACG GAACACTATT TTAGTCGTGT ACGGAACACC 120
GTTAATACCT ATCATCTTCC GTACACATGC GAAGGCGGTA CTTATCCCAT CTTTTCTCAA 180
AAACTACTGG TCCAAAAGAC ATCAATCAAG ATTTGTATTG TGCAATAGGT ATTCCCCCAG 240
AGAATGAACA CACAAGCATG CTTATCTGGC TTTCAATGAC GGAGGAGTCG TCGTTTGAGT 300
GCGCTGAATA GCGAAAAGTG TACGGAACAT GGTTAGTCTA CGTTAATTAA AAGCCAACAC 360
TTTTATAAAC AATAGCTAGC CTAATGCTAA CGTTACCTCT GCTAAAACTC TAACGGACTT 420
TTTCCAAAGA CACAACAGTC TCTATAAAAA AACATGTTCA ACAGAAATAT GTCAATTACC 480
AGTAAGAAAA GTGTCAGAAA CAGTTATATG TAACATTTGC GTGATTTTAG CGACTAAACT 540
TACCTGAAAT TAGCGAAAAC TGCCGCATGA GAGAAGTGCT GTTGACGGGC AGGTGTCGTG 600
TCGTTGCTCC GTTTCCATGA CAACGCTCTC TGCTGCAGTG CTTGAATGGG GCTCGGTAAT 660
GGACACTTTG AAGTCACGCA GCATTTACAT AAACATTTAA ACAATTTATA AACATATTAA 720
ATAATGACAT TTAATATTAA ATCTTGATTT TTAAACTTAA TTTTGTTTTG TTTTAATAAT 780
AACCTGTTAT ATTTAAAACC TCTTGTAGTT TTATTTACTA AACTTTGCTT TTATTAATAA 840
CTATATTTTT ATTTAGTGCC TCATTCGTTT AAAATGTAAA AAGTGTTAAA CAAAAGTACT 900
TTTATCAGGT ACAGAACAGC CAACAACATT AAAAACATCA CCGTGTGGGC CATCGGTTAG 960
CCACTGGTGT CCAGACGGCG GTCCACCCAC GGTAATCCGC TGGTGGCGTG CCACCCAAAA 1020
AAAACGCCGG TGGGCCGACA TAACTTTTAG AATGGGCGGC TTGCCGCTGG TAAGCCGACG 1080
GCGGTCCGCC CATATCAAGC CGCTGAATTT GTGCCGACCA AAAAACGCCG ACGGTCCGCC 1140
AACTCATTGT TTGCTGGGTA TAAAAACTAA AACTTTAACT TTAAATCGGT TTACATCTGT 1200
AAACGTTTTA AAACAAACCT TACTCCAGTT GAATTACAGC GCTGAAGT 1248