EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35334 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:28339479-28340972 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr4:28340017-28340028ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr4:28340017-28340028ATATTTACATA-6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:28340651-28340666GAGGTGAAAAGGTCA+6.88
POU1F1MA0784.1chr4:28339923-28339937CAAATTTGCATAAA-6.03
POU2F1MA0785.1chr4:28339925-28339937AATTTGCATAAA-6.11
POU3F1MA0786.1chr4:28339924-28339936AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr4:28339924-28339936AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr4:28339924-28339937AAATTTGCATAAA-6.78
POU5F1MA1115.1chr4:28339925-28339936AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr4:28339922-28339938CCAAATTTGCATAAAA-6.8
RARAMA0729.1chr4:28340651-28340669GAGGTGAAAAGGTCACAT+6.64
RarbMA0857.1chr4:28340650-28340666AGAGGTGAAAAGGTCA+7.4
RargMA0859.1chr4:28340651-28340667GAGGTGAAAAGGTCAC+6.93
ZNF24MA1124.1chr4:28339658-28339671CTTTCATTCATTT+6.09
Enhancer Sequence
AGATTAGTCG ATAGGAGAAA CACCTGTTCA GGAGGGAAAG ATAACAGTGC TTTTATAGTC 60
TTACAATTGT GAAGAAAGAT AAAAATGTGA GTGAATTGAT ATCACTCGAG TAACTGGTTT 120
ACTTTTAGTC TGAGATGTTA TTTAAAGAGA TAGTTCAGTC ACACTCAAGG GGTTGTAACC 180
TTTCATTCAT TTGTTTTTTT CTGTTGAACA CAAAGGAAGA CATTTTGAAG AATGTTGGTG 240
GGAAAAACAG CCACTGATAG GTGAAAAAAT ACTATGGCTG TTTTTATGCA ACATTCTTCA 300
GAACATCTTC ATTTTCAATA GAAGTCGTGT GTGAGTAAGG GATGGCAGAA TTTTCATTTT 360
TGTGTGAACC TTTCATTTAA CATCTCTGTC TTGAGACAAC TACATTGTTA AATAAAGAAA 420
GGGCATTTTT GAGGGTCAGA TCACCAAATT TGCATAAAAA CGTAAGCTAT CCTTACCTAC 480
CCTCTCATGT TTTACCTCCA AAACACAAAT AAAGATATTT ACAATTACAA TTATAATTAT 540
ATTTACATAT ATTTATATTT ACTATATTTA CAAACCATTA ACAATCCCTT CAATATAGCA 600
AGAAATTGGT GCTTAAACTA CAGTTTTGCC ATTTTGTCTC CCTCCTATTT AAATTTGTTC 660
ATGAATATTT TTTTAACATA TGGCTAAAAC CATTCATATA GATTTATGTC CTTTTGGCCT 720
AAGTTTTGGT TAACTGGACT TAAAAGGGAC CAGAAATTAA AAAAAATAAA AAATAAAAAT 780
CTCCATTCGT GTTTCAAGGA TTCAAGGAAG TCCTAAGGGT TTAATAAAGA GAATAAATGA 840
TGACAAGAGT GTTCCTTTTG GTTAAACTAA TTCTTTAAAG TTGGTTCTAA ATCAAAATTT 900
ACAATATTTA AGGAAAATTA TAAAATCCCT TTTGACTTAT CTTTTGAGTG AGATGCTAAT 960
GGTCTAATCC AATTCAATGA TCTATGCTAA GCTAAGCTAA AAGTGCTCCC GACAGACCTG 1020
GAGGCCGGTT GAAGGGATTA AAACAAATTG TAAAACTTAA CTGTTTAACT CTAGAGGAGT 1080
TGTAACAATA TCAGTGGAGT GTTTCTTTAA AATCAAGCCT AGGGCTCAGT CACATGTTTT 1140
CCCTTAAGGC TCGTTTCCTT TTCCCTGGAC AAGAGGTGAA AAGGTCACAT AAGCAGTGTT 1200
AATAGCTGCC TAACATCTGA CATGTCCGAG GAATAAAATG CATTAGCTTA TTAGACACCA 1260
GAGAAAGAGA TGTGTGTGGA ATTGGAGGGA GTAACAGAAG GTGGGAACTG CTACGGTGAT 1320
GGAACCCGGT GTGTCTTTGT CATGAATGAG AGAGCAAGGC ATGAATGCGG CTCATTACGA 1380
CCCCAACAAT GACCATGAGC ATGCACATTT AGATGAGCAA CGGTAATCAG ACTGACAAAG 1440
ACACCGCCGT AAAGCCAAAG TACAGACAAG AGAGCTGTGT TCTGGGAGAT GTA 1493