EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35276 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:27084709-27085935 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr4:27085482-27085497AGGAACTGGTTTTTC-6.6
IRF1MA0050.2chr4:27085618-27085639TACTGGTTTCTGTTTTTTTTT+6.24
Lhx3MA0135.1chr4:27085174-27085187AAATTAAATAATC+6.03
Enhancer Sequence
GTAGATGAAG GCCTAAATAT CCACATTTAA AGTAGTTTCA ACAATATTTT GTTGTTCTAA 60
ATAGTTGGCC TTTTACAGTC CAAGTATACA TGAAATAATG CCAATTTGTT AGTCTGATCT 120
CTAACAACAT TGAATAGCGT GCCACGCTGC TCCGTCTAAC ATGTTTTAGT CCGTTACTAA 180
CCTGTACAGT GGCTTGTAGT GCTATGGACA ACAACATTTA TCAGTGATAA TAACACAAAC 240
TCTGTTTGAA TCATTCAAAA CATAACAATT TATTAGTCAG GTAAATGTAT TATGCCAATT 300
CAATCAGTCA ATTCATAAAC GATCAATACA AAACATCAAA TTATCAAAGA TAACTCCAAG 360
ATGAAAAAGA TGCATTCCTG ACTTTAAAAT ATACATAACA TGGAGCTAGC CATGTTATGG 420
GCTGATCTGG TTAGGCAGAA TCGCCCTGAG TTTTTCTCAA CCCTTAAATT AAATAATCCA 480
AAAATTCCCT CAAGGAAGGG GGTGTGAATG TATAACAAAA GGCATTCACA CTTAGTGTCA 540
CACCCCTCAC AGTGGTTCAA AAGATGCCTG AAGTTATATA TTTATTGTTC TGATTATGTC 600
TATTTCTGAG AGAATGAGAC CATTGTACCA ATCGCACTGA GACATTTCAA ATGATATCAA 660
ACATGATGGT TAAAGTCAGT TTGGTTAATT TAAAACATTC AAACATTGAA ATGACCATAT 720
GCGTGAGTTG GGGGATGAAG CTGAGTCTCA GCATAGCCAG ATGCAAATGC AGCAGGAACT 780
GGTTTTTCCC GCATTCCTCC CTGGTGGGTT GTGAAGTCAC CAGTCTCTGT TTTCAGCTCA 840
TGTTTTGAAT TGTCAAAGAT ATCAGAATAT TTGTAATATT TCAATTCTTA CAGTAAATTA 900
CATTAATTAT ACTGGTTTCT GTTTTTTTTT TTCTTTTCAG CGGTGGCACA AGATGACTAA 960
ACCTACCGAG CTCACAACCT CAGATGTCAA TGATCTCACA CATACAGGGA TTATGGATGA 1020
AGCTTCTGTC TGACATCACT CTTTCCTGTT AAATGACCTT TAAATACCAA TTGCAAAACA 1080
ATACCCCTCT ATTTATTTTT TTTAAATCAA AGAGTACACT GAAATGGGCT ATGTGTTTGT 1140
AAGTCTGTTT TCCTAATTTC TTTCTGCACA TTCATTCCTG TAATAAGAGT GGGCTGCAGT 1200
ACATTTGTGG ATAAATTAAT TGCATC 1226