EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35184 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:24996093-24997199 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC13MA0907.1chr4:24997184-24997195GCTCGTAAAAC+6.14
PBX1MA0070.1chr4:24996828-24996840TTTGATTGATGT-6.74
SOX10MA0442.2chr4:24997034-24997045AAAACAAAGAA+6.62
SOX15MA1152.1chr4:24997110-24997120AAAACAATAG-6.02
YY1MA0095.2chr4:24996820-24996832GCTGCCATTTTG-6.18
ZSCAN4MA1155.1chr4:24996529-24996544AACACACACTGAAAA+7.06
Enhancer Sequence
ATGCAAATCC TAAACTTAAT TCAAAATTTA GCAAAAAGCT AAAATGCTAC ATATATGTAA 60
AACATGCAAA TACTCATTCA AACTACATGC ATTCTTGATA ATCATGATAT CAGAAAACTC 120
TTATATCAGC AATCATTAGA GCATTCCAAA AAAAACTACA GAAAGTGAAA GAATGCAGTA 180
ATGTTCGGCC TGAAGGATGA AGAGAACCTG AGGGAGAAAC CACTACATAC CTTCCTTTTG 240
AAATGACTCC TAGTTTTTCG GGCTTCACAT GGACCAACCT TTGATTTCCA AACTTCAAAA 300
GCCCACAGGC TTCACAAACA GTACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AACGACACCC 420
AAGAGAAAAA CACACAAACA CACACTGAAA AAGCCTCTTG GCCCCCTCCA GGCCGCCTCT 480
ATTCATCCAG CATGTGTCTG CCTCATTAGC GCTATTAGCA TGGCTGAGAC GAGGCGGGGT 540
GATTTATCTA ATCCTGCTGT GAAGACACAC GGCTAGTGGA AAGAGACTCG CGCAGGTCAT 600
GACACCTCTG TGGTAGAGTT AAATGAAGAT TTATTACAAG TACGACACTC ACAAACTTGA 660
GTGTCAACAT GCTATGTCAA CTGTATTTAA TGCTAAGCAC TAATAGTGTG CTGCTAATGT 720
TAATACTGCT GCCATTTTGA TTGATGTGTA AATTACATTT ACAAATGATT AGGCATTTAC 780
TTGTGTTACG ATTTAACATT TAGCATTAAA TGTGCTAAAC AGGTGAGTTA TGTTTAATTT 840
TTAGCATTAA ACATGCTAAC GAGGTTAGTG TAAAGATTGC ATGTTTGTGA AGTAAATGTT 900
TTTTTTTTTC CATTTTGGTA GAGAATGGTA TATTTAACAT CAAAACAAAG AATAGAATGA 960
GTCTATAGTT ATTAGACAAA GTCACACAAA TGTTTATACA TAATTGCCTT ACTAAAAAAA 1020
ACAATAGACA AAAATGTGGT ACAAATTACA AGTACTGTCC AAGTTTCAAT GTGATTTTAT 1080
TTTAATTTGT TGCTCGTAAA ACTTTG 1106