EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-35058 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:20573168-20574774 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr4:20574665-20574676TAAGTAAACAT+6.02
FOXC2MA0846.1chr4:20574665-20574677TAAGTAAACATA+6.27
Sox3MA0514.1chr4:20573181-20573191AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
GATGGACAAA GCCAAAACAA AGGTGTTAAG TCTGTAGGTG CTTGCTTACA GCGATCACAT 60
AGGGTCCACG TCTTAAGTTA TTTTTAAAAG CAGTTTACAA TCTCTCCTGA AAACAGATAA 120
TTTCAGGCTG GTGTCATCAG CTGAAGTGAG AGAGAGTGTT GCTAATGAAA CAAGGAGGAG 180
CAATTATCTC CTTTTGCTCT GCCATTGCAA CTGCTAATGT TCATGTGTTT TCCATAGCGT 240
GACTTTTAGA TACTAAATCA GATGTCTGTT CGAGCAGGTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 300
GTGTGTGTGT GTGTTTGTGT TTGTGTGTAT TTTGAGAGAA TGTTGCCAGT GCAGGTTAAG 360
CTTTGGCTTA AAGTACTTTT GGCTGAATTC AAAGAGTAAC AGGAGGTGTG CAGGTCATGA 420
CCTGCCAGCA TTAAGATGAG ATTTGGAGAC ACACTGGAGT TCACAAGGAA TCTCTTTGCT 480
TTAAGTACAT ATATAAGTCT GTGAGGGCAG AGAGCAAGTG TAAGAGATTT TTGTTGTGTT 540
TAATAATGGA GCCCAACAGC TAAAGGGTTC TGTCACATTT TGCAGAAACA TTGATGGGGT 600
TGTTGGCATG TGTATTCAGG GTTAAGATAG CTAAACTTGT GTGAACTGGA CTCACGTTTC 660
AGGTGATATC CTCATCTGAG CTTGAGTTTG GATGGTCCAG CTTGAACACA GCACCCAGAG 720
CAGTGTGACG CTCCTCATCC TACCCATCAG CCCCTGCCAC ATGCATAAAA TAGCAGGATG 780
TGTGAACTCC AGTTCACTGG CTCCTGAAGA TAGACCACGT GTAGTAATCC CAGTTTGGGC 840
TTGATATCAG AATGGGTCCA ACAGACACCC TGGACTCGTC AGTGTTTTTG TGTAACACAG 900
AAAACTTTCC AGTTTGCTCT TCTGAAATAA TTACATCCAA CTCGTCTCTC CCCATTCCTG 960
ATCATCCACA TGTTCATCTC ATCTTTCTGT CAATCGCTTT TCCATTGCTC TTTCTTACTC 1020
TGATTTTATG GAGAGCCACC AAGGATGTCT TCCCTCGCTC TGACTGGCCC ACTGGAAACT 1080
TTTGCGGATC GGACTCTCTC ACACTTATGT TCTTACACAT CTTATGTTCA TCGCAGCTGG 1140
GAGGAACTGA AACAGAAGCA GATACTGTAC TGCATGCTCA CTCACTCAGT TGCCCTCCCC 1200
GCTAAGATAA TCCACATGGA TTACACTCCA CTCCCACAGT GGGGGGAGAG GGACAGAGAG 1260
GGAGTGATGA ACTGTAGAAG ATGTAAAGTG GTATGGGTGT GGGGCAGATG TATTGAAATA 1320
GACAGATAAA AACAAAAGGG TAAAAGGGTC TCTGTCAAAG GATCACTGGT GTTTCTGGAG 1380
ACAGCCCTGA GGTCTTGTTT ATAAATTTGC CGTATGCACA GCAACGTCCC ACGCAAAGGT 1440
TATCATCTAT AATAAACATA CTTGACGGGA TGAATATGCA CAGTTGTAAA TAAATTCTAA 1500
GTAAACATAT TTATTTCAAA TATTGACTTA ATTGTACCAC TTTAAATCAT CATTTGAGCC 1560
ATTTAACCAA GAAGAGACTT TTAACCAACT TTATCAAAAG TGTTAA 1606