EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34992 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:18555017-18555973 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:18555937-18555948ATTTTAATTAA+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:18555196-18555211TGACCTTGTAACCTC-6.38
RFX3MA0798.1chr4:18555750-18555766TGTTTCCATGGTTACT-6.13
RFX4MA0799.1chr4:18555750-18555766TGTTTCCATGGTTACT-6.12
RFX4MA0799.1chr4:18555750-18555766TGTTTCCATGGTTACT+6.31
RORA(var.2)MA0072.1chr4:18555533-18555547TTGACCTAGATATA-6.95
RORCMA1151.1chr4:18555534-18555546TGACCTAGATAT-6.07
RarbMA0857.1chr4:18555196-18555212TGACCTTGTAACCTCT-6.04
Enhancer Sequence
AAAACTAGTT GTTAAGTTTA GGATTAAAAC TAATTAGGAC CATTTACTAG GAAGGCTTTA 60
TATTTTTAAG TTCAGCAGAT TTGCATTCTT CTCTAGACGA CAAGGCTTTT GTTGTAACCT 120
CTAGACTTGT GGTTAGAGTA AAGATAGTGA CTGGCACCTC AAAGTGAAAA TGTGAGTGAT 180
GACCTTGTAA CCTCTTCCAA GATAAACAGA GCACGATTCC CTTTGTGCAC ATGTCAGTTT 240
TCCTTAATAT GTGCTTAGCA TTGGTGTAAA AACGGCAAGA TGACTTTGGA AGTCATACAG 300
GCTTTTGCGC ATGCTGTACA TGCACTCGAC AGACATGTGT ACCCTTAAAG GGTAAACATA 360
CCAGCTCAGA GCAAGACACA CCCGTGCACA CTTGTGGCTA ACTTGCAGCA AACGCGAAGT 420
ACATGAAGAA CAGAAGGCTT CATGTGTTTT GGTATGAGAA GGGGTGTTTC CTGAGCAATC 480
GTGTTTGTTT GGGGAAGTGT GGTTGGTGAG GTATTGTTGA CCTAGATATA GTTTTGAGCA 540
TGCAACCATG TCTGTTCCTC CCCCCAGCTG AGCTATGCAG GTGCTTCAAG TCAGAAAGTC 600
TTTGACTGGA AGTGCTCCAA CTCTGTGACT AGAAAAGAGG CTCTTGAGTC TCCGTTTAGA 660
AGGGGCATTA AATGTTTGAA TACGGTGTTA ACAGCCTGCT CGAGTATCTG AGCGGTCTCT 720
GTGGTTATTC AAATGTTTCC ATGGTTACTT ATCACCCAAT CGGATGTCTT TGAATCCACT 780
CTGACCCTCT GAGCTGTGGG TTGAAGGTTC CTGTTTGCAG AGCAGGTTTG AGTCTTTCCC 840
CCCTGGGGCA AAAGTTTCAG GCTGGGGAGG TCAGCTTTGG ATGGGTTATT TAGTGCAGCG 900
TTAACCCTCC TCCAACACCC ATTTTAATTA AAGCATTTGT CAACAGAACA ATAAAA 956