EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34902 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:16654254-16655490 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:16654435-16654446ATAATTAATAT-6.02
HOXA13MA0650.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
HOXB13MA0901.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
HOXD13MA0909.2chr4:16654597-16654608GCCAATAAAAC+6.14
Enhancer Sequence
GCTTGACTGT ATATTCTGCC TCTGACGCAA TTCAAACATG GCAACGCGTT TGAGAAGAGA 60
GGAGGGGCAG AAAAATGGGG GCAAGAAAGT AATGCGATGC CGTCGCGGAA ACCTCGACCA 120
AAAGTGAATT CAACACGCTT AAATGTGTCA CCTAAAGTTA CCCATATCAT ATAATAACCG 180
CATAATTAAT ATTTTGCGGC GTTTAGACGC ACGGCCGTCC GCGCACTGCA GTGAAATGGT 240
GCGCGCGTCC CGCTGTATTC ACCGCCCACC AGCTCGCGCG GAAGCATGGC ACGCCACACG 300
GCATCTTTAA ACACACACAT TCAGCAGGTT TTCGCCGCAG TTTGCCAATA AAACGACCTC 360
TGCTCTGTGC GAGGAATCAA TTCGCAGGGT TTCCCTGATG TTAGACGTGT CTAATAAAGA 420
CAGCCAGCTG AAGGAAAGCG CTCTCCTCGT CCGCTGCTCT TTGTTTTCCG CGCGGCTCTG 480
CGTCAGTGGC TCGTGCGCCT CCATGCTTCG CGCTCGAGAC TGTAAACACA TGCTGTCCGC 540
GTAACAACTT CACCCAAGGA CACAGAGCGC GACTAAACTC CCATTTGCAA GTTTATTTCA 600
TCAACAGGAC GATTTAAGAC ACTTTTAAAC ACTCCAGCGC AATACTAAAA CATCGATTTT 660
ATTAGCTCCA CGATTAAATG CGTCAGTGAC ACCGCCTCCA TCTCTCATGA AATGAATCTT 720
TAAGACTACC ACAGCTAGTT TTTATAAACG TCGACCTCTT TTGAGTTCCA GAAGCAGAAG 780
TTTGTAAACG CATGTTGACG AGCTTGTGAA AATGCGGGTT TGTTTTGAAG CACACCCACC 840
AACAGGAGTG AACAGACCAC ACGCAGTCAC AAGGATAGTT CACTATCCCA AGTTCAAATC 900
GAGTATAAAC AGCGAAACTT GTCCTAAATG CGCGCAATGT GACGCCACGT TCGCGTTTAT 960
TAGATATTTC GTGTACATCT TATAATTCGC GCACCTATTT ATTGGGTTTT TAAACGGAAT 1020
ACGAATGCAA ATGTCCTATT TTTAAAAGCT CTTTCTATCT AAACAATCAT CCAGAGCGTG 1080
TTTCTAATAC GCCTAAGTTC TGTTATAAAG AAAATAAATC AATTCCGGCG TCAAATGTAT 1140
CGATTTAGCC ATAAAACACT TAACAGCAGC GATCCCCTGT AAAGGATGCG AGCGCCCTAA 1200
AATGTGATGC GCGGTATGAG CAGCCTCACC ATCAAG 1236