EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34831 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:15018062-15019303 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr4:15019187-15019200CTGATTTAATCAG+6.23
ESR1MA0112.3chr4:15018927-15018944AATGTCAGAATGACCTC+6.13
FERD3LMA1485.1chr4:15019104-15019118GTAACATCTGTTGC+6.05
FERD3LMA1485.1chr4:15019104-15019118GTAACATCTGTTGC-6.81
IKZF1MA1508.1chr4:15018300-15018312CCTTCCTGTTTT-6.18
TFAP4MA0691.1chr4:15018167-15018177AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
GCGTCCCAAA GTGTAAGTTT GATTGTGTGG CCATCTATCA GCCGTTTACC TCTTTGGTGA 60
TGCTAGTGGT GCAGAGGTTA AAGGTGAATG TCTTTAATTG CTGAAAACAG CTGATGGCAG 120
AGCCTACTTT ATTATAGCCC TCTAAGCAGG TGGCAAACAT GACCAGAAAG TTTCTTGATG 180
AACTCATTGA CAGTTGGACT GTGTCCATAG AGGAAAAACA CTGCAATGAT GTAATTTACC 240
TTCCTGTTTT ATTTTGGTCA GCTAGATCCC ACGGACTATT CACCCATACT TAAAAAACAA 300
CATGACCACA GTAATTGCTC AGACTGTCCA GCCTAAATGA TTTCCTGTAA ACTGTGGTTT 360
GTGTGCTATC CAAACATTGC TTTTCTTTTA AGGGATTTTA ACACATTATT GGCTTAACCA 420
GTCACTTTGA GGCGGGTCTA ACTGTTAGGA AGTTTGGTGA TGTTTGTCTT TAGAAATGAT 480
TTTTGATTGA GCTCAGTCAT GTCAGGGCAT ATGCGCAGGA TCTAGGAGAA CTATAAAACA 540
GTATGGTAGG AGTACTGTCA CATTTATGTC ATTGCAAAAC ACATGCAAAA GAAGCCCACC 600
CTCCCCCAAA ATACACAAAA TTCCCCTAAG GGTGAGCCAA CAGGTGTGTA ACAACTGGGA 660
ACAGGTTTTC AAAGTGCCTC CTGTTGCTTG GAGTTCTGTA AGTTTTCTGC AATATCCTGA 720
AATGCGTAAA CCACCTTATG AAGGTCAACT GTTTAGAGAG AAAGTTGCTG TTATGATCGG 780
ACGCAGCAAT CCACGCTCGC TAATTTGCTG CAGGCATCAG AGAGCTGCGG ATCTGGAGCA 840
AGCTCAACTG GGAATTCACG AAATGAATGT CAGAATGACC TCGCTGTGCG GAGCTTGCCT 900
TAAGCACTTC CTAAGCTCGA GCGAGAGAGA TGATGACCCG TCTTTGACAT CAGCAGATAC 960
TTCTGAAACG TGCTCGAACA GGTCAGAGCT GCCTGTTAGC TTTGACGGGT CAACGTGGAA 1020
TAGCGTAATG TCAATATGTT GTGTAACATC TGTTGCACTT CCCACTTAGC CTATCGCCGG 1080
TTCATTGAGA GATATAGGTC TTTTGAATTT GTTTATCTGG AACTCCTGAT TTAATCAGCG 1140
CGGCTTGAAC TCTTGTGCTT TCTCACATTG CCAAACCACG TCTTGATCTA ATTAGTTCGA 1200
GCAACTGTAA CTGAAGTTTC TGTGTCGTAC TGATTTCTTT G 1241