EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34599 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:9619432-9620509 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CremMA0609.1chr4:9620193-9620203TTACGTCATA-6.02
LMX1BMA0703.2chr4:9619875-9619886ATTTTAATTAA+6.62
RUNX1MA0002.2chr4:9620258-9620269CTCTGTGGTTT+6.14
SOX10MA0442.2chr4:9619756-9619767AAAACAAAGAC+6.14
Enhancer Sequence
CACAACATTC GCAGAGGTGG GGATTGAACC CCGGTCTCCC CGATTGCAAA ACTAGCGCTT 60
AAACACTTGT ACCACTAAAT CGTGAAATCA AATTCCACTC CCATTAACCC TAAATATATT 120
GTAATCAACG CTGCAGCTGT ACTGATGAAT TTAAATTACT TATACTTAAA TCTGACATCT 180
ACAGACGCTA CTAATTCTGT GGTGTAGAGG ATAATCATTC GCTCTTGGCA TCTTCTATAA 240
TGCAGAGACG TGGGTTCAAA TCCAGCTAAT GTGAGATGTT TGTAAATTAA TGCTAGAGCT 300
GAGGTATAAT CAAGAATCAC TTTGAAAACA AAGACACTAA AATGGCTGCT GTCTCTGTGG 360
TGCAGAGGAT AACTATTCGC CTGTAGCATG GATTATAACG CAGAGTTGTA GGTTCGAATC 420
CCGCTCTTGC TACAGTCAAA TGTATTTTAA TTAATGCTTA AGCTTCAGTA AAAACAATAA 480
TCACTTTGAA AACAAACCCA ATGATCAACA CTAGCTCTGT GGCGCAGTGG CTAAGTTCTT 540
GTTCTTTGCA TGTTTTATAG TGAAAAGTCA GGAGTTCGAA ACCCACTATT GCTAAAGGGA 600
AGAATGTTGA AACCAATGCT TTAGCCGTAG TAACAACAAG CATCAGTCTG AGAGCAAACA 660
CACCGTGATG GTCACTGCCT CTGTGGCGCA ATGGTTAAAC ATTTGTTCTT TGCCTATTTT 720
ATGACGCAAA GGTGTGGGTT TGAATCCCAC TCTTGCAAAC ATTACGTCAT AACTGCAGTC 780
TGACCTTTAG CTAAAAACAA AAAATTCCAC ACATCAATCC AGCAACCTCT GTGGTTTAGT 840
GGTTGAATGA TTGCATATCA AACAAGAAAG GTTAGGTTCA AATCCCACCT TTGCAACAAT 900
TTTTCTGCAT ACACATTAAA CATATCAATA AAACTCTGTT TGGGACACAC ATTATCTACA 960
CAGGCCCAAT GGGTCAGTGG ATAAAGACCT CAGCTTTCAT CTTGGAGACC GGGGTTCGAA 1020
TCCCACTTAT GTTTATGTTT AACTGTTGTC AGAAAAAAGA CAAAATTGCA CGAAGTT 1077