EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34490 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:7737504-7738304 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
CDX1MA0878.2chr4:7738138-7738149GTTTTATGGCC-6.62
CDX2MA0465.1chr4:7738139-7738150TTTTATGGCCT-6.02
CDX4MA1473.1chr4:7738138-7738149GTTTTATGGCC-6.32
FOSMA0476.1chr4:7737882-7737893GATGAGTCACA-6.14
JUNDMA0491.1chr4:7737882-7737893GATGAGTCACA-6.14
MSCMA0665.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr4:7738063-7738073AACAGCTGTT-6.02
Tcf21MA0832.1chr4:7738061-7738075AAAACAGCTGTTAC+6.53
Tcf21MA0832.1chr4:7738061-7738075AAAACAGCTGTTAC-6.53
Enhancer Sequence
TAAAGCCTGA CCATGTGCAT CTACATTTGG AGTGTGGACT GTTCTGTTGA CGTCAGTTTA 60
ATGAGTTCAG CCACAATATT CTTAGCCACG GCTCTTGCAC TGTTAGTTTG CTATGAAGGA 120
AAGATGCGCG AAAAAAGCTT AAAATATTTA GGTATTTCTG TTTATACAGA CTAAATTAAT 180
CCATAAAGAA AACAGGGCTT TCCTAAAGAA CTAGAACTTT AATAAAAATA TGTGCTACTT 240
AGTTATTTTT ATGTAAGACA GCTTAAATAT TCAATTTAGT TGAGGACTAC CCTTAAGCCT 300
AGTCTGTGAA AACTGGAGAA ACTGTCATTT AAAACATACA GGATGTATTT GCTGTCGTCT 360
TTTTTTCCTA AAACTTGAGA TGAGTCACAA AATTAAAACC AAGCATAGCA TTAGTAATAT 420
AATCTGGGGT TGTCAAATCA GAGAATGACC CAGAATAGCC AATTAGAGTG TAAATGTGAG 480
CAACCGTGAT TTCTGTTTGG TCCGTTGCAA CACTAAAACA GGACCTGCAG CATTTTCACA 540
GATTTTTTTT AAGGGTCAAA ACAGCTGTTA CGGAAGAGAT TATATTCCTG GGAACTGGAA 600
TGAAAGAGTG TAAAGGTGTG GTTGTGGCTC TGTAGTTTTA TGGCCTCCTC ATCAGACTGA 660
GTCCCCCAGG GGTGAAATAA TGGCCTCTCT TTATCAGGCC GAGGCAGTAA AACTGCTAAC 720
CTGAAGCTCA TCCATTACAC CACTCTGTAT GTCTGTCTGT CTCTCTAATA ACGGCGCTTA 780
ATTAAAAGTA TTTTTGGCCA 800