EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34169 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:702602-705050 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF3MA1418.1chr4:704770-704791TGCTTTCCGTTTCCGATTATT-6.04
RARAMA0729.1chr4:702781-702799AAGGTCATAAGGGCACTT+6.79
RESTMA0138.2chr4:702942-702963GGGAGCACCTGGGACAGCTGA+6.01
RFX1MA0509.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA+6.24
RFX1MA0509.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA-6.26
RFX2MA0600.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA-6.58
RFX2MA0600.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA+6.6
RFX3MA0798.1chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA-6.52
RFX3MA0798.1chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA-6.37
RFX5MA0510.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA-6.58
RFX5MA0510.2chr4:703656-703672TGTTGCCATAGAAACA+6.59
RarbMA0857.1chr4:702780-702796GAAGGTCATAAGGGCA+6.32
RargMA0859.1chr4:702781-702797AAGGTCATAAGGGCAC+6.09
ZNF24MA1124.1chr4:703344-703357CACTCATTCATTA+6.08
Enhancer Sequence
ACTTTCACTT GCATTATTAT TACAACGCTT TGTATCTTTC ACGTTTACAC TTATAAAGAA 60
ACCATGTTCA ACCAACAAGG TGACAAATGC ACAGATTCTC TGGAAACACT GCCGCGAACA 120
GGAAAACTAC TTCAACAGCA AAGGTGTAAC TAACATAACA GGAACAGATG TATGGAAGGA 180
AGGTCATAAG GGCACTTGCT TTCTGTTTCA TGTGCAATTC TTTTGCCTGA ATTTCCACAT 240
TTCAAGTACA AAGGAAAGAC CTTAACTGCT CATGGGTAGG ATCCCTAATT TACCTGAGAT 300
AGGATTGGTG CTAAAGAAAT TACTCAACTG GCCATGAGAA GGGAGCACCT GGGACAGCTG 360
AGATCCTGTT AGTGGAGATG AGAAGCTTAA GGAGTTCTGC TAATGTGTAC ATTTACGTTG 420
AATGTTACCA CAAAGAAGCT GAACACAAAG AACTCATCAC ACACTCACAC CACCTGTCTC 480
TGTAGTTACT GATGCTGAAA CAATAAACTG CTTTGCCTAA ACACTTCACA GATCTCACAC 540
TTTATTCTTT TTTGGACTAA TTTTACTTAC AAACTTAAAC TATATTTTGC AGACCACAAT 600
CTGCATTTAT CCACAATAAC ACACCAAACA CTCCACTGGC ACAATAAGCA AAGCACTCAG 660
GACACCACCA GCAGCGAACT CTACAGAGAA AGCATCACAT CATCTCACAA CTATTACTTC 720
ACAATCCATC TGCACTAAAT ATCACTCATT CATTACAACA ATGACTATAT TGATCATTTA 780
ATGCTTTCCA ACTCAATGGG AAACGCATCT TTCTGCTGCA GTGCCTGTTA ACACGCAATG 840
ACATATATCA ACTGTTCTGC CAATATGTAT AAGCTTTGCA CAGTTACAGC CTCAGTTGCA 900
GTTTCAGATT GTACCAGCAC ATTTTTCGGT GCATAAACAA ATATTACACA CAACTTCATC 960
TACTTTTCAT CAGCATCAGT GAGCTGGATC ATCTAAATAT TACTATTTAC AATCCATAAG 1020
TTCATGCCTA GTCATTGAGC TTCCTTTAAA TTGTTGTTGC CATAGAAACA TTCTCACAAG 1080
TTAGAATCAG TTAATTGCCT CATTTAAAAA AGAACACCCT ACAACAAGAC ACTTACAATC 1140
CACTGTAGAG GCGTTGTCTG TAACTTTATT ATCTGTTTGT GTTTATATTC TATCTCACAT 1200
ATTATTGTTA TGTATACAGA TGACTATAGC TCACTTTATG CACATCTTTT TACATAGTTT 1260
CACTCTGTTC AACATACCCA ATGTGGGATG GAATAAAGCA GCATTCCTCC ACAATCTCAC 1320
GTGTTGGAAA CACCTTCTCT GTCTGTCTAC CTTTGGGAAG AGAGACGCCG GAGTGAGGGC 1380
AGAATAATCA GCATCTTCTC AATGTAACCT CAGAAAATAT TATATCCTAT TCCTTCTATG 1440
CTGATGAAGG ACTACTGAGA CATTCCAAAC ATAGGATAGC TGCTCCTGGT GTGGCACAGT 1500
TCCTCACAGC TCCAATACAC ATCTCTGCCA TTTGCTTACA GTAACCATGT GCTCTTCACC 1560
ATACGCAACT CATCTGCTCG TGATCTTCCT TCAGATAACT GTGTCATGTC TGGAGTCATT 1620
TCACAGTTCA TGACTTCAGC TTTGTAGTGA TGAAATCAAC AGAGACATTG ATAGATTAAT 1680
TCCAGTTCAA TCTACAATAT ATTTACTATT GGCCTGAGGA GAGTATGTTA ATGTACTTCT 1740
CCCCCATTTT ATCTCCTCAA CTTTGCTCTC ATGTTCAGCT GCTTTTGGGG GGTTGCTTTT 1800
CACTCATGTT TGACAATGCT TTGCTCAGGG TATAATAGGG AAAGGTAACT GTTGATCTGG 1860
GAGAATGGCT TTTACTCTGC ATCTCCCGCA CACCGGTGCA TAGCCTCATA TGCTAAAAGG 1920
CAGTTTGACT GTCTTTGTTA CACAGCACTG CTTCCGTTAC AGCTAATTTC TTTATACAGT 1980
ATGTTAGTTT GTTTCATTGT TTCATTCAAC TGTCTGTATA TTTAAACATG TAACTTAATA 2040
AATATCTTTG CCTGCTTGAA GACGTACACA TTCTTTCTCT TTATCAACGA TAACAACAAC 2100
TTTAATGGAG TCACATTAAT TACAATGGTG TCAGATAAAT AATGGATTTA AACACGCCAT 2160
CCTTCAACTG CTTTCCGTTT CCGATTATTG GTTCAGAATA GCAGCGTACC CTGCTAAAAA 2220
ATCCAGCTTA ATCCAGCCTA GGCTGGTTGG CTGGTTTTAG CTGGTCGACC AGGCTGGTTT 2280
TAGAAGGGTT TTGGCCATTT CCTGGCTGCT TTCCAGCCAT TTCCAGCCTG GTCTTAGCTG 2340
GTCAGGCTGG AAAATGACCA GCTAAATCCA GCTTAAACCA GCTTGACAAG CCTGGTTTAA 2400
GCTGGACATA GCTGGTTTTG GCTGGTCATC TCCCAGCCTA GGCTGGTT 2448