EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34145 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr4:162139-164397 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr4:163753-163765GGTGACGTCACA+6.44
CREB1MA0018.3chr4:163753-163765GGTGACGTCACA-6.44
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr4:163753-163765GGTGACGTCACA-6.32
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr4:163753-163765GGTGACGTCACA+6.62
Foxa2MA0047.2chr4:162241-162253TGTTTACACAGG-6.14
Lhx3MA0135.1chr4:162495-162508CAATAATTAATTA+6.39
PBX2MA1113.1chr4:163784-163796GCTGTCAATCAA+6.32
ZNF143MA0088.2chr4:162412-162428TACCCATAATGCAGCA-6.38
Enhancer Sequence
TCTGCTTTAG AGCTTATCAT GGAGAGATAA TACTGAGAAT AATAGAGTGA TGAGCATTAC 60
CACATGATGA AGAGCAGGAG TGTCTGTGAT GTGCTCGGTG TGTGTTTACA CAGGTAAATC 120
TTGTGTTCTA CTCAGGGGAG CTGATTGCTG TTGGGCTGGG CTTTTAGTTG GAGGTTTATT 180
CTGTTGTCGA GAGCCATCTT TGTGGATAAT TTCAGCACAT TCATTTTATT TATCCAACAC 240
AGATGAACAG CGAATTTGTG GAGGAAACTA CATTACCCAT AATGCAGCAC AGACGTTTCC 300
ACCAATCACA GAGCCACAAT ATTCCCCATT TAAGGAGGGA TGCAGCCGGA AAATAGCAAT 360
AATTAATTAT GATATTTACT AAATTACTCA TTAATTCTGA TTTGTGTACG TCTGTTTTAA 420
AACACTAACT GACCCAGCCG GGACTCGAAC CAGTGACCTT GCTGACACCA CTAAGGCACA 480
CAGTGCCGCC CAACAGTAAT TATACTGAGT GTTCTCAATT AAATTTTATT TTATGAGGAT 540
CTAACCTTCA CAGTGATGTT AGAATACAGC GTGTTGTCGG TAATAATAAG GTAAATAACT 600
CGGGTTGTCC TCCGGCTGCA GCTGTATCCC CTCTAGACTT GACTGCGAGT CACGAGCCTC 660
TTCATGAAGT GTGCGATGTT GTGAAGGTAA TTGCTCTGAT ATTATAGATT ATAACACTTA 720
TAATAATACA CTTATTAGGG GAAATACATT TAAAATGATT ATACTACAGA AAAGTAGACG 780
GGATTAACGA GTGAACGTAG TGGAGCTCCC AGAGGGACGT TCGTCCAATC AGATTAAAGG 840
GATTTGAATA TTCATGATCG GCATAATGAG CGCAGGTGTA GACGATTGAA GGAGCACACG 900
TGACATGAGC GCTTATAAAC ACCAGCAGCA GCAGAGCTTC CGCACACTCA CAGGCTGCTT 960
ATCAAGCCGC AGGAGGTTAG AGAAGGTATT TACCCTCAAT TCCTTTACTT CAGCCTGAGT 1020
CAATGCATAC AGTGTCTAAC AAACACACAC ACACACACAC ACAGAGAGAG CAAGTGTGTG 1080
TGTCCAGATC CAGCACAGTG AGAGATTTAC ACACCTCACA CACGGCCCGA ACAGCCCATA 1140
AACACATGGA GAGACACACA AACACACCAT ATCTGAAGAC TGAGCTTTAC AATGAGGAGA 1200
TCTGAACTGC CTTCATAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1260
ACACACAGCG GATTATCACC CCAGACACTA ACAGTAATGT GTGTGTGTTT GATTAGATGG 1320
TAGTGTATTG TCATTGGCCG ATGTTCATGT TAATCTGAGC TCTGCTGAAT GTCCGTCATC 1380
TGCAGTCTGC CAACTCATGC CTGCGCCTCA CAGATGATGA TGATGATGAT GATGATGATG 1440
AACACCGAGC TGAGAGCAGA CTGACGGAGG AGCGCTGGAG CAGGACTTAA CACAGGTAAG 1500
AGGAACACAC ACACACACAC ACACACACAC GAGTGTTTCT CAGCACTGCG CATCAGTGCC 1560
TGATCTAGCA ACAACATCTC CAGTGTTGCC AAGCAACAGC AGCACGGCCT CCAGGGTGAC 1620
GTCACAGAGT GCTCAGCTTT GAGCTGCTGT CAATCAAACA GTCATAAAGA GAATACACTA 1680
TAATAACTGC AATAATCACA CACACACACA CACACACACA CATCTGACAT GTCCGTCCAG 1740
ATCTGTCCTT TATTTTAGAT GTGCATGAAT GCTGTTGGAC AGTGGGGAAA TGAGCTGTGC 1800
TATTGATCAT GTAGCATTAT TAGTGGAGTT TAATCCCGCT TGATGTGCTC AGAACATGAC 1860
GTGTCAGATG CAGATCATGA TGGAGGATGT GAGGGCAGTG CACAGAGAGT CGGTATGCCT 1920
AAAACACTCG TGTTCAGTCT CCTGTTAGCT CTAGAATGAG CTGGAAACAC AATGACAGAC 1980
GCGTATATTA ATCAGCTCTT CCTCATTCTC TCTCATATTT CTATTAGAGG TGTTAATAAA 2040
GTCAGTTAAT CAGATGTAAA AGTCGGTCGC TGCGCTGTCT CCGCCATGTG GACAAACGCG 2100
GAACTGCAGC GGCAGCCATG AGAGAAAAGA ACTACAAACA TGGCGGACAT TCGTGCTATT 2160
ATTGAATCCT TGACTGTGAT TGTGCCTGTG AATGCTTTGA TTTTGTTTTG CATTTAATAC 2220
ATGTATTTAC AGCATTATTA ATCATATATC TGTGGAAT 2258