EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34116 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:62011760-62012768 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:62012014-62012033TGCTGCCATCTAGTGTCTG-6.01
Foxa2MA0047.2chr3:62011980-62011992TGTTTACTCTGG+6.11
NR2F2MA1111.1chr3:62012428-62012439TCTGACCTTTG-6.14
SP1MA0079.4chr3:62012303-62012318AAAACCCCGCCCACT+6.33
SP2MA0516.2chr3:62012302-62012319AAAAACCCCGCCCACTC+6.23
SP4MA0685.1chr3:62012303-62012320AAAACCCCGCCCACTCG+6.11
ZNF24MA1124.1chr3:62012604-62012617CATTCCTTCATTC+6
Enhancer Sequence
AAAAAGTTTA TTAATGCTCA AACCTTCTAA TATAGTTCAA TTAAAACTGG TCCACAATTC 60
CTCCGCAGAG ATATGAAACA CTAGCCTGAT TACTTCCAGT TGCTGCTAAT GGTGGCACAA 120
CCAGGTATTA GATTTAGAGG GCATTTACAT GTTCACATGT GGCTATGGCA GGTTTGGATG 180
TTTAGTCCTT AATAAATGAG ATTATTTTAA AGCTGTTTTG TGTTTACTCT GGTTTTCTTA 240
GTTTTTTGAC TGTTTGCTGC CATCTAGTGT CTGAATAATG CAGAGGTAAG TGTAAAAAGG 300
GTTTCTGGTT TGTAAATATT CATTTATCTA TTTTTGTTAA TAAATAAGAA TGTTAAAATA 360
TATTTTATTT TTATGTAAAG CTTCTGTTTT GTAATTAACA AAATCATGAA ATAAGTATTT 420
AATCTTCTGA CCACAACTGA TTCTCTCTTT TGTCGAGAGA CTGATTGACA TATAAGCAGC 480
CAATCGGCTT TCACAGAGCG CCTACAAGCA GCCAATCTGC TTTCGCTGAT CAGCGTGCAG 540
GCAAAAACCC CGCCCACTCG ACTCAGTTGT GAGGCGGAGA GTGCAGAGCT TTGCTGTTTG 600
CTGTTGAGTT GCTTTAACTC CACTTCTGTT TCGGGTGTTG TGCGTCTATT CAAAGTAAGT 660
GTATTATATC TGACCTTTGT AGCGTTCGCA GATTTGCTGC AATTATCTTG CGGGTTGAAC 720
TGCTTTAACA TATGTGCTCA ATGCTAATAT AGTCTCTTGT TTTTAGCTCG ATGCTAGGCT 780
GTAAACACTT CTGTAATGCG TTACTCACGG GTTATCTGGC CACCTTTCAT TTGTGTCTCC 840
ATCTCATTCC TTCATTCTGT AAACACTGTG ATATTCCCAT CAGGCTCCAG TGAAGAGTTT 900
ATTGAAGGAC AGCGAGAACA TGAGTGATCC AGAACCCTGC AGAATTAAAC ATGAAGACAC 960
TGAACAACAA ATAGGTTGGT GTTTATTCCT GATTCTTCAT TAATCAGC 1008