EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34114 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:61997975-61999311 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:61998964-61998975TTATTTACATA-6.02
NR2F2MA1111.1chr3:61998648-61998659TCTGACCTTTG-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr3:61999197-61999210TAAAACACTTAAT+6.16
Enhancer Sequence
TTCAGAACAA CCCAGTGTAC ATCAGCTCTG CCTGACTACA ATGGTTTTAA CACAGAACAT 60
GACCTGCCTG ACAGAAACAC TTCAGCCATA CTGTCCTCCT TCCTCCAGCG TGCAGAACTC 120
ACTCCACTAT TGATTCATGA GTTTAAAGAG TTTTGCAGAT GACCAGAGAT GTGCACATTT 180
ACATATCTAC ATTTGCTGAC AGAATATTTG AGCTACTTGG GAATCGTGGA CATTATCGGC 240
CCGACAATAT TTAATTGGAA GAACATTTTT TAGTTTTCTG CCTCACCCAG AATACATAAA 300
CAAAAATAAA CACATTCAGA TCATTTACTT TAATCATTAT TAGTGGACTG AAGAGTCTCA 360
ACCAGCATGT TTCAGAACAC AATCACCTAC TGCACCTTTA ATCTTCAGAC CATAAATGTT 420
TTCCTCTTTT GTCGGGAGAC TGATTGACAT ACAGGCAGCC AATCGGCTTT CACTGGATGC 480
CTACAAGCAG CCAATCTGCT TTCGCTGAGG GCCTATAAGC AGCCAATCAG CTTTCTCTGA 540
TCAGCGTCCG GCGTTCCGCC CACGGCGCTC AGTGTGAGGC GGAGAGTGCA GAGCTTTGCT 600
GTTTGCTGTT GAATTGCTTT AACTCCACTT CTGTTTCGGG TGTTGTGCGT CTATTCAAAG 660
TAAGTGTATT ATATCTGACC TTTGTAGCGT TCGCAGATTT GCTGCAATTA TCTTGCGGGT 720
TGAACTGCTT TAACATATGT GCTCAATGCT AATATAGTCT CTTGTTTTTA GCTCGATGCT 780
AGGCTGTAAA CACTTCTGTA ATGCGTTACT CACGGGTTAT CTGGCCACCT TTCATTTGTG 840
TCTCCATCTC ATTCCTTCAC TAAGTGCTTG TTTCAGAGGT GTGTTGTAAA CAACTTCCCA 900
ACAAACACAT CTGTTACAGC GTAGAAATGT AAGACTGGAG AGGCCTGTAG CAGCTGAGGA 960
GATCTGGGTT TACTACATTT GATGCTGGGT TATTTACATA TTGACTATTC TGCATATGAG 1020
AAGTAGACCT AAGAGTGTTT CAATACTGTT TAATATTGAT TATTGATCTT TTTAACTTAA 1080
TATCTGCTTG TGTAAACTTT GAAGAGAAAT AAATCCATAA CAATTAATAA AATCAATCTT 1140
TATTCCATAC AAAACATTCA TACATAAAGA TTTATAATAA CGTTACCGAA GGGGAAATAT 1200
TTATTAAATT AGTATAATAG TATAAAACAC TTAATAATGA ATGTATTACA GTATTGAGAG 1260
ATAACTGTAG GCAATCAGAG ACATGATCAC GCTGCACACA TGAGATGTAG AATCGGCCAC 1320
TCAACACTTA CACACA 1336