EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34088 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:61136002-61137483 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:61137222-61137237ATTGTTTATGTAATG-6.09
Foxo1MA0480.1chr3:61137062-61137073TGCTGTTTACA+6.14
RFX1MA0509.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG+6.98
RFX1MA0509.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG-7
RFX2MA0600.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG-7.28
RFX2MA0600.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG+7.3
RFX3MA0798.1chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG-6.91
RFX3MA0798.1chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG+7.54
RFX4MA0799.1chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG-7.22
RFX4MA0799.1chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG+7.2
RFX5MA0510.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG+7.12
RFX5MA0510.2chr3:61137308-61137324AGTTGCCATGGAAACG-7.19
TFAP4MA0691.1chr3:61137210-61137220AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
TCAGCATAAT GAATGAGGTG AAAACAGAAA CTACTGATAT GAGCTAAAGA GGATTTCAGC 60
AGCTCCGATT ATATTGATGA GCTTCAGATT ATAAAGACTC ATTAAACAAG CCATTCAGGA 120
TCAACAGCAG ATCAGCTCAA CTTTATAAAA TGAAAATCAA AGACAACTGA GATTCAGACC 180
CTAATCTACA CCCTACAGAT ATCCATGCAC ATAATTCTTA TGTAATATAA ATTTAATCAA 240
TGCAAGTGTA ACCAGTCAAC TTTTACTTAA GCAAAGAAGA CACCAAGTAC AAGTACTGCA 300
AAATACAAGT TACATTAGTA TAAAATGGCG ATTTGCTAAC CTGCTTTTAG CACCAATACT 360
AAACTCTGAG ACCTGAAAAT TCCTACAAAA ATTACATTAG CGGCGAAACA AAACAAAATC 420
ACGCAACAAA GCTTTCATAA ACATCACAAA CATTAAAACT TACAACATAA ACAATTAGCT 480
TTTCCAGAAG AAAAAGAAAT GTTTTCAGCA GCATTTCTCC ACACAACTTA CCCTCAGCGA 540
TGCACAGCAG CAATGAGACG GAGCGAGGAG AGGAAGCGAA GAGGTACGGA AACCCGGGAG 600
GTACAAAAAC GACGATGTGT ATTATATTAT CACAGGACAC AAATAAAAAT AACCGCTAAA 660
TAAAATTCAC AAATAATGAA CAAAATAATT AAATAAAAGT TGCAAATTCT AAAAATATTA 720
GCTATTTAAC AGAGTGCATT ACTTCTTTTA CACAAAGATA AAAATTGAGT ATTTGTGAAG 780
AAAAAATGTT GTTTTTTGTG TTTAGGTTTT CAAAGATAAT CTCAGCCTAC TTCAGTATAA 840
AATTAACTTT GTCATGGTTT CAGTGTTTAT AGTGGGAAAC TGCACTGGTT TTACATAAAC 900
TTTGATGAAA TGTCTCCAAC ACACAAGTCT GTATTTTATC TTTTAAGTTT TAAAAGCAAA 960
TAGTTTATAA TGTTTTAATG ATTTTTGTGA GCTTTAGATC GCCCGTTTCA GTTACAGTTT 1020
TCTTTCAGGA GTTTGATATT TCTCGTTCTC AAAATATTAA TGCTGTTTAC AATATATTTA 1080
CAAATCTACT CTATATTTTT CCTGCTGCTT CATGCACTGA TCAGTACTTT TCAGACGTTT 1140
ATGAAAGTAG GTAAATTTGT GCCACCAAAC GGTGACGGAA CAAACAAGCG AAATCAAGAT 1200
TTACCTCTAA CAGCTGATGT ATTGTTTATG TAATGCTGTT CTGATGTTTA TTTGTGTAAA 1260
TGCTGCGTGA TTTTGATGCG CGCGCTGAGT CTCATTCAAA TGCGGGAGTT GCCATGGAAA 1320
CGGGGCAACA ACACTCTGTC AGGCAGCAAA ACTCCGTCTC TCGCTACTGT TTTCTCGGCT 1380
TTCAGGTAAG TTCAGAGCAT AAAATCATTA AAATATATTA TAAAATGTTT TGTGACTTAA 1440
TCTTTCTTAT TTATTTATTG TAATTTAACA CGTTTCTGTT G 1481