EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34087 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:61129412-61130703 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX9MA0781.1chr3:61130401-61130418TGCACCCATGGGTGACG-6.03
RFX1MA0509.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+6.98
RFX1MA0509.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7
RFX2MA0600.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.28
RFX2MA0600.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.3
RFX3MA0798.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-6.91
RFX3MA0798.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.54
RFX4MA0799.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.22
RFX4MA0799.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.2
RFX5MA0510.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.12
RFX5MA0510.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.19
STAT3MA0144.2chr3:61129726-61129737TTTCCCAGAAG-6.62
Enhancer Sequence
AGTGAGATTC AGACCCTAAT CTACACCCTA CAAATATCCA TCCACATAAT TCTTATGTAA 60
TGTAAATTTA ATCAATGCAA GTGTAACCAG TCAACTTTTA CTTAAGCAAA GAAGACACCA 120
AGTACAAGTA CTGCAAAATA CAAGTTACAT TAGTATAAAA TGGCGATTTG CTAACCTGCT 180
TTTAGCACCA ATACTAAACT CTGAGACCTG AAAATTCCTA CAAAAATTAC ATTAGCGGCG 240
AAACAAAACA AAATCACGCA ACAAAGCTTT CATTAACATC ACAAACATTA AAACTTACAA 300
CATAAACAAT TAGCTTTCCC AGAAGAAAAA GAAATGTTTT CAGCAACATT TCTCCACACA 360
ACTTACCCTC AGCGATGCAC AGCAGCAATG AGACGGAGCG AGGAGAGGAA GCGAAGAGGT 420
ACGGAAACCC GGGAGGTACA AAAACGACGA TGTGTATTAT ATTATCACAG GACACAAATA 480
AAAATAACCG CTTAATAAAA TTCACAAATA ATGAACAAAA TAATTAAAAG TAGCAAATTG 540
TAAAAATAGT AGCTATTTAA CAGAGTGCAT TGACTCTGTT ACACAAAGAT AAAAATTGAG 600
TATTTGTGAA GAAAAATGTT GTTTTTTGTG TTTAGGTTTT CAAAGATGAT CTCAGCCTAC 660
TTCAGTATAA TATTAACTTT GTCATGGTTT CAGTGTTTAT AGGGGGATCT GCACTGGTTT 720
TACATAAACT TTGATGAAAT GTTCCCAACA TTCAAGTCTG TATTTAATTT TTATGTTTTA 780
AAAGCAAATA GTTTATAATG TTTTAATGAT ATTTGTGAGC TTAACAACAT CTGTTTCAGT 840
TACAGTTTTC TTTCAGGAGT TTGATATTTC TCGTTCTCAA AATATTAATG CTGTTAACAA 900
TATATTTACA AATTTACTCT ATATTTTTCC TGCTGCTTTA TGCACTGATC AGTACTTTTC 960
AGACGTTTAT GAAAGTAGGT AAATTTGTGT GCACCCATGG GTGACGAAAC AAACAACTGA 1020
AATCAAGGTG TAACTTTAAC AGCGGATTTA TTATTTATGT AATGTTGTTC TGATGTTTAT 1080
TTGTGTAAAT GCTGCGTGAT TTTGATGCGC GTGCGGAGTC CCATCCAAAT GCGGGAGTTG 1140
CCATGGAAAC GGGGCAACAA CACTCACTCT GTCAGACAGC AAAACTCCAT CTCTCGCTGC 1200
TGTTTTCACG GCTTTCTGGT AAGTTCAGAG CCTAAAATCA TTAAAATATG ACATAAAATG 1260
CTTTTTGATC TTGATCTTTC TTAGTTATTG T 1291