EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:61122428-61123534 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr3:61122887-61122899CTAATGGTTTTA-6.22
FOXE1MA1487.1chr3:61123289-61123304ATTGTTTATGTAATG-6.09
RFX1MA0509.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.33
RFX1MA0509.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.36
RFX2MA0600.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.54
RFX2MA0600.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.56
RFX3MA0798.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.52
RFX3MA0798.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.89
RFX4MA0799.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.27
RFX4MA0799.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.28
RFX5MA0510.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.33
RFX5MA0510.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.38
Enhancer Sequence
AACAGTTAAT TTTACCAAAG GAAAAGGAAA TGTTTCCAGC AGCATTACTC CACACCACTT 60
ACCTTCAGCT ATGCACAGCA GTAATGCGAG GGGAAGAGGT ACGGAAACTC GGGAGGTACA 120
AAAAGGACGA TGTGCATCAT ATTATCACAG GACACAAATA AAAATAAGTG GTAAATAAAA 180
TTTGAACAAA ATGTTAAACA AAATTAATAA AGTAGCAAAT GTAAAAATAA TTGTTACTTA 240
TCATTAACTC TGTTACACAA AGATAAAAAT TGAGTATTTT TGAAGAAAAA TATTGATTCT 300
TGTGTTTTGG TTTTCAAAGA TAATCTCAGC CTACTTGAGT ATAATATTAA CTTTGTCATA 360
GTTTCAGTGT TTAAAGTGGG AAACTGCACT GGTTTTACAC AAACTTTGAT GAAATATCCC 420
CAACATACAA GTCTGGCTTT ATTTTTTATG TTTTAAAAGC TAATGGTTTT ATAATGTTTT 480
AATGGTATTT GTGACCCGTT TCAGTTAGTT TTTTTTTTCA GGAGTTTGTT ATTTCTCATT 540
CTCAAAATAT TAGACTACAC AGGAAAAAAA AAAGTTTTAA TATTTATATT GCAATATTGC 600
TGATTAAATA TCCAATAATC ACCCACCACA AGACATTGTT CTTGGACATA AGGGGGGCTC 660
AATCAAGTCT GCAAATCGTG TACTCCTTTT CTTATTATCC TTTTAAAATA TTGGCCAATT 720
TCGGACTTCT GTCTTGTATG AAGATTTGCA AACGTTATTT GAAAATGACA TACTGTATGT 780
CCAGTGATTC TTCTCAGCAT AACCAGAAAA CAAAGCTACA AACATGTTAA TATGGTAGTG 840
TGCCATAAAA TTTAATTATT TATTGTTTAT GTAATGCTGT TCTGATGTTT ATTTGTGTAA 900
ATGCTGCGTG GTTAACAGAT GCGCGCGCGG AGTCGCAGGT GTTGCCATGG AAACGGGGCA 960
ACAACACTCA CTCTGTCAGG CAGCAAAACT CCGTCTCTCG CTGCTGTTTT CACGGCTTTC 1020
AGGTAAGTTC AGAGCCAAAA ATAATACAAA ACAAACACAA AACGATTCCT GACTTGATCA 1080
TTCTAACTTA TTTATCGTAA TTAACA 1106