EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-34050 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:59955229-59956111 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF7MA0834.1chr3:59956062-59956076ATGTGACGTCATCG-6.02
CREB1MA0018.3chr3:59956063-59956075TGTGACGTCATC+6.02
CREB1MA0018.3chr3:59956063-59956075TGTGACGTCATC-6.02
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr3:59956063-59956075TGTGACGTCATC+6.14
JDP2(var.2)MA0656.1chr3:59956063-59956075TGTGACGTCATC-6.32
JUNB(var.2)MA1140.2chr3:59956063-59956075TGTGACGTCATC-6.11
Myod1MA0499.1chr3:59955421-59955434AGGAGCAGCTGCA-6.15
Sox11MA0869.1chr3:59955571-59955586AATACTGAAATGGTT-6
Enhancer Sequence
GGGGACAGCT GTGCTGATGT GATTAGCTAT GGTATCATCT AAAATGCTAA TTAAATGTAT 60
GCCCAAAACT GGAATATCGC ATAAAAGACT GCAAATAAAG CAGCGTTTCT GTCCAACAAG 120
TCAAAGAGAA CAAAATTGCC ACCTGATTAA CTGGCGACAA ATATCAAAAG TAAAAACAGA 180
ATTAGCATCA GTAGGAGCAG CTGCATGAAT AAATTATCTT CATTTAATAA GTGACTTGCG 240
CATCAGAAGG CAATCCTGCA CGCAGTGAAC GCGCGCTGGA AGGCGCGAGA CACGGAGTGC 300
AGGCACTCTT GACAATTCTG GAGGTCATTA TTAATATAAT ATAATACTGA AATGGTTAAG 360
GCGGTTTAAA ATGACCAAAA CAACACTTTA GATGTTTTAC AATGTGCTTA GCCTGCTGGT 420
TTGTCCATTC ACACACATTT TCAAAATATA TGCGCATTAT AGCGTTTCCA TCAACCGTTT 480
TTATGTGCAT ATCCAAAAAG CGCAAAAAAA GGTGGATGAA ACCTGCCCTC TGCTGTACCA 540
TCCGGCTTAC ACAGGGTTTC CGTGGGGTCT TAACATGTCT GAAATATAAA CATCTAAATT 600
TTAGGCCTTA AAAAGTCTAA AATTCGCTGT TCTAGGTCTG AAATATGTTT GCACAGGTCT 660
TATTTTTCCG ATGTACATGT AACGCTACTC CTAATGCTCA TTTAATTTTT TTTTTGTTGT 720
TGCTTGGTTT CGTGGTGGTG TAGTTCTTTA TTTCACTATT CCTATTGTAA TTTGCAGTAT 780
TAAAACTACA AATAAGAAAA GACCAGCATG CAATAGCTCA GTGCGCGCGG CGAATGTGAC 840
GTCATCGCCG TGCTTGCGGA GGTTCACTTT GGACGCGCGC GA 882