EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33966 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:56879122-56880369 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:56879907-56879918CTAATTAATAT-6.02
DBPMA0639.1chr3:56879856-56879868TGTTACGTAACT-6.04
SOX21MA0866.1chr3:56879204-56879219GACAATAACATTGTT-7.09
Sox1MA0870.1chr3:56879204-56879219GACAATAACATTGTT+8.18
ZNF24MA1124.1chr3:56880235-56880248GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr3:56880239-56880252CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880243-56880256CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880247-56880260CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880251-56880264CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880255-56880268CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
TCAGCTGCTA TTTTGTGGAT TATTTTTACG TTGCTTTTTA TAATTTCCTT TTTAAAGTAG 60
TGGTTAATTA CATTATAGTT AAGACAATAA CATTGTTGAA AACGACAGAG GAGATTCGCA 120
ACAGAGCGCT GATATTCACA CACACACACA CACATACGCA TGACACCTGT ACAGCTGTCT 180
TATTGTATGG GCAAACACAA ACATGATTAT TCTGAATGAA CAACACCGAC TCACGCATAT 240
AATAATAATA AACAGCCTGT AAAGCCATGG TTGTGTATGT GTGCGTGTGT ATGTGTGTGT 300
GTGAGGTGTT GCAGAGGTCT GGTAGGCGCA GTCTCTCCAT CTGGAAACAA ACACACGCTC 360
CTGGTAAGAG CCTCGCAGAA CAACAGTCAC ACAAACCTGC GTCTTCGTGG TCAGCTGTAT 420
CACCGCCTTC CTGAAATTGA GCTTTGAGTC GGAATTCCCC ATTTTCTGCT GTTATGATGG 480
TTTATTGATG AGGCGCTGCT GTAATCCCGT CTCCTCCTCC TCTGCGTGTG TCATTCGCGG 540
AGGCGGCGGT GCTGCGCTAA AGCCGCAAAC TTCCGGGATG ACTTTAACAT TCCTACTATG 600
GGCAAGGAGA AGCTCATGAA TATTAACGAG GCGATGCCGT AAAACCAATA GGCGTCGCTG 660
ATTGGCTAAA CGCCACCCCG AGTTTTAGAC AGCCAGTAGT AAATGAGCCA CTAATGGATC 720
TTTAATATTA CTTATGTTAC GTAACTGGAC GCAGAACAAG GGTTACCAAG CAACGCATGT 780
CGGCTCTAAT TAATATTCAT AAGTGCGAAT ATCCCATAGT AGGATTCGTA CATTCCAAAC 840
ACACTAGGCA GTGCAGTTGC CAGGGAAAGA CTGTTTATCA AATACTTCAT TGAATCATTT 900
AGCTTTCACG GGCATATCGA CTCATTTTGC AGTTATTTAT TTATTTAACT ATACTTAATA 960
TATAACTAAT GTAAAAGCAT TTCCATAATA AAATCCAAGC AACATAAATT CGACTGGTGT 1020
AAAATGTAGC TTTCGGGTTA CGCAGTTATT TAGCATATTC ACCATTACAA AAACAACAAC 1080
AGGAAAACTG CTCTTATATA TGATCAGGTA ACTGATTCAT TCATTCATTC ATTCATTCAT 1140
TCATTCTTTT CGGCTTAGTC CCTTTATTAA TCTGGGGTCT CCACAGCGGA ATGAACCGCC 1200
AACTTATCGA GCATCTGTTT TACGCAGCGG ATGCCCTTCC AGCTGCA 1247