EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33926 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:55374255-55376096 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:55375900-55375911ATTTTAATTAA+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr3:55375627-55375638AGGCACTCAAG+6.14
RREB1MA0073.1chr3:55374508-55374528CCCCCACACACACACACACA+6.95
ZNF282MA1154.1chr3:55375834-55375851GGCGTGTTCTGGGAAAG-6.92
Enhancer Sequence
TTAGAGACAC AAGATGAGAA TATTTGTGCC CTCACAGGAT TGCTGCCTGG CTCCATACTT 60
CTGTCTGTCT GTCTCTCTCG CTCTTTCTTT TCGTCTTCCT GCTACAATTC TATGCCTTCA 120
GAAACCATTA GTGCCCATTC AAAATAAACA TCAAGGGAGC GCTTTGATGT GTCTCTTGGC 180
AATAGCCCAT GTCTCAGTCT CTGTCGCACT CTTTTCCTTC TTTTTTCTTC CTCATTTATC 240
CTTTAACCCT CCTCCCCCAC ACACACACAC ACACCCTTCT GTTTCTCCCG CATTTCACAG 300
CCGAGCATTT TTACCTGGCA AATAAATCTA TCAACAGAGA CCTTTTTGGA AGGGGGGGTT 360
GAACCAGTTT GGAGTTCCTC TCTAAAGTGT AACAAAAGTG AGATAGCACA ATGGACCTGG 420
CCTGCCATGT GAGCTAATTC TGGCTGGAAA GTGAACTAAG GCAGTCTCTT TCTCTCCCTT 480
TCACACACAC AGAAGCTGGT TAAAGCCGCC AGAGTAGCGC TTAATGCCAA TTACCACCCC 540
ACACAATGAA GTGAATGAAA CAGTTAGTGC TCCTCAGAGC GAGCCCCTGG CACACACTGC 600
CTGATATGGT TACTGCGCTG CCTCCCACGT GCTGCGCTTT GTGCCATGGG AAACGAGAGC 660
ACTGATATCA TCAATCCAAC GTTGCAGCAT TGTCTAAATG AATCAGGAGT GAAGTCAGCT 720
AACGCTGGAC TCGTGGTGGC AGATGGCACC TGCGCCTTCC ACGACAGCAC AGCAAAGATC 780
GCAGGATGTT GTTAGGCTTG CGTTTAGGTG GGAAGGTCAT GGCCGTTTAG GGAAATATAG 840
CCAAGAGTTT CCTAGATGAT TTCACTATCA AAGCACAGGA AACTTTAAAA TAGAGCTTGC 900
TGGAATGAAG GACAATTAGG AGAAGGGAAG TGACAAGTCA AGGGTCAGCC GTGCTCTGAT 960
CTCTGCCAGG TTGCGTTTGG CATTCCATTC AAAGGAGGAA AAAAAATGTA AACGCTTAAG 1020
CGTAGGACAT GCTGAAAACA CTTAGCACTT CAACCTATCT CTAAGCTTGT ACAAGCTTGT 1080
ACACGCAGAC AAAAAGGGCT CTAGTGGCCA AATTACTGCT GCATTTATTA ATTTTCTACG 1140
AGGGAGCAAA TTAAAGGCTG ATAATGGGAA CAAATATGGC TGGGATTTCT CACCGGGGTC 1200
TGAAGTGCTT CATTATGCCG CAGCATTGTC TCTGAGCATG CTGGGCCAGT GGTGCTTCCA 1260
GGGGCATTCT AATCCTCCAA TTAGCCCCAG GAAAAACCAG CTGCCCAGGC CCTGGCAAAG 1320
CTCACGTATC CCGATGCAGA GGTAAAGGAC AGGGCCTGGT CCAAGTTTGG AGAGGCACTC 1380
AAGGAAAGCA TATCACCATT AAAACCTCCT CCCACTTTAT GGTGAACACT TGAAATGCAG 1440
AACTAAGGCA GCCAGATAAA ACCGTTCTCA CATAAAACTC TTGCGACTCT CGGCCAAAAT 1500
GGTGACAAAA GCAACCTAAT GTCTGAATCT GCCCTCCTTC CCAGTCTGGA GCTTGAGAAA 1560
CGTACCGGAG GAAGTAGTAG GCGTGTTCTG GGAAAGGCCT TCACCTTGGA GTTGGTTTCT 1620
CATGGAAGGA GCTACAGGGG GTGAGATTTT AATTAAGCAT GGAGGTGCTG GGACATGGCT 1680
GGAGGGAGCT GACGGGAGAA TGATCTACGA ACAAAGCCTT CTATGGTGTA CAAACAGCCA 1740
CAGAGTTACC CCCAACTGGC AGAAACCCTG CCTGCACTTT AATGGATGGG ATTAACAGCC 1800
AATCAGGGAG TCTCTTTATG ACATCCTCAT GCTATCATTC A 1841