EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33909 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:55104642-55106698 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr3:55105436-55105450GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr3:55105621-55105635GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr3:55105897-55105911GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr3:55105989-55106003GGCCAGGGGGCACC+6.12
CTCFLMA1102.1chr3:55106271-55106285GGCCAGGGGGCACC+6.12
PLAG1MA0163.1chr3:55105907-55105921CACCCTTGGGCCTC-6.31
PLAG1MA0163.1chr3:55105525-55105539GAGGGCCAAGGGGG+6.73
PLAG1MA0163.1chr3:55106079-55106093GAGGGCCAAGGGGG+6.73
PLAG1MA0163.1chr3:55106452-55106466GAGGGCCAAGGGGG+6.73
Enhancer Sequence
CCAGGGAGAG AGGTGGACCC CTGGGTAGCT TGCTGGGGGC AGAAGCCCCT AGGTGGAGGG 60
CCAAGGGGCA CTCTGGGGCC TATACTGCAA GTCCAGGGTG AGAGGTGGTC CTCCAGGTAG 120
CTTGCTGGGG TCAGAGGCCC CTAGGTGGAG GGCCCGGGGG CACCCTGGGA TCTACACTGC 180
AAGTCCAGGG AGAGAGGTGG ACCCCTGGGT AGCTTGCTGG GGTCAGAGGC CCCTAGGTGG 240
AGGGCCAGAG GGCACCCTGG GGCCTATACT GAAAGCCCAG GCAGAGAGGT GGACCCCTGT 300
GTAGTTTGCT GGGGTCAGGG GCCCTTATGT GGAGGGCCAT AGGGCACCCT GGGGCCTATA 360
CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG GTGGACCCCT GGGTAGCTTG CTGGGGTCAT AGGCCCCTAA 420
GTGAAGAACC AGGGGCCACC CTGGAGCCTA CACTGCAAGT CCAGGGAGAG AGGTGGACCC 480
CTGGGTAGCT TGCTGGGGTC AGAGACCCAT AGCTGGAAGG CAAGGGGGCA CCCTGGGGCC 540
TATACTGCAA GTCCAGGGAG AGAGGTGAAC CCATGGGTAG CTTGCTGGGA TCAGGGGCCC 600
TTAGGTTGAG GGCCAAGGGG CACCCTGGGA TCTACACTGC AAGTCCAGGG AGAGAGGTGG 660
ACCCCTGGGT AGCTTGCTTG GGTCAGAGGC CCCTATGTGG AGGGCAAGGG GTTACCCTGG 720
GGCCTACACT GCTAGTCCAG GGAGGGAGGT AGACCCCTGG GTAGCTTGCT GGGGTAATAG 780
GCTCCTAGGT GGAGGGCCAG GGGGCACCCT GGGGTCTAAA CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG 840
GAGGACCCCT GGGTAGCTTG CTGGGGTCAG AGGCCCCTAG GTGGAGGGCC AAGGGGGCAC 900
CCTGGGGCCT ATACTGCAAG TCCAGGGACA TCGGTGGACC CCTGGGTAGC TTGCTGGGGT 960
CAGAGGCCCC TAGGTGGAGG GCCAGGGGGC ACCCTGGGGC CTCTACTGCA AGTCCAGGGA 1020
GAAAGGTGGA CCCCTGGGTA GCTTGCTGGG GTCAGAGGCC CCTAGGTGGA GGGCCCGGGG 1080
GCACCCTGGG GCCTATAGTG CAAGTCCAGG GAGAGAGGTG GACCCCTGGG TAGCTTGCTG 1140
GGGTAAAAGG CCCCATGCTG GAGGGCCAGG GGACACCCTA TGACCTATAC TGCAAGTCCA 1200
GGGAGAGTTG TGGACCCCTG GGTAGCTTGC TGGGGTCAGA GGCCCCTAGG TGGAGGGCCA 1260
GGGGGCACCC TTGGGCCTCT ACTTCAAGTC CAGGGAGAGA GGTGGACCCC TGGGTAGCTT 1320
GCTGGGGTCC TAAGCCCCTA GGTGGAGGGC CAGGGGGCAC CCTGGGGCCT ATCCTGCAAG 1380
TCCAGGGAGA GAGGTGGACC CCCTGGGTAG CTTGCTGGGG TCAGAGGCCC CTAGGTGGAG 1440
GGCCAAGGGG GCACCCTGGG GCCTCTATAC TGCAAGTCCA GGGAGAGAGG TGGAACCCCT 1500
GGGTAGCTTG CTGGGTTCAG AGGCCCCTAG GTGGAGGGCC AGGGGGCACT CTTGGGGCCT 1560
CTATTGCAAG TCCAGGGAGA GAGGTGTACC CCTGGGCAGC TTGCTAGGGT CAGAGGCCCC 1620
TAGGTGGAGG GCCAGGGGGC ACCCTGGGGC CTCTACTGCA AGTCCAGGGA GAGAGGTGGA 1680
CCCCTGGGTA GCTTGCTGGG GTCAGAGGCC CCTAGGTTGA GGGCACGGGG GCTTCCTTGG 1740
GCCCACAATG CAAGTCCAGG GAGAGAGGTG GACCCCTGGG TAGCTTGCTG GGGAATAAAG 1800
CCCCTAGGTG GAGGGCCAAG GGGGCACCCT GGGGCCTCTA CTGCAAGTCC AGGGAGAGAG 1860
GTGGACCCCT GGGTAGCTAG CTGGGGTAAG AGGCCCCTAA GTGGAGGGCA AGGGGGCTTC 1920
CTGGGGCCTC TACTGCAAGT NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1980
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2040
ATGTGGAGGG CAAGGG 2056