EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33893 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:54879293-54880117 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr3:54879493-54879510TGACCCTTATGTTACCT-6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:54879493-54879510TGACCCTTATGTTACCT-6.26
Enhancer Sequence
CGGTTATGGA ATTTCATGAG ACAAGATGCA ATGTTCCAAT GCATTTTCTA ATCTGAGAAG 60
TGATGAAGAA ACCAACTGTT CCACTGTTCT ATTCAAATCA CTGTTGACAA TGCAAACACA 120
GGCTGGAGAA ACAGAGCTAC TCTACAGCAG GGGGTAATGC GAAGAAGTCA CCATTCCCCT 180
ACCACCTAAA CCCCCCTTCT TGACCCTTAT GTTACCTTCT GATTAGAGCA CATTTCACAT 240
AAAATGTTCA AGGTTTTAAC ATGGTGTATC TTGCAGCACT ATATTCACGT TTGGTATAAT 300
TTTAAATGTC TCTGTGTGAT TGGTAAAGTG GTCTTAATTT TACAATAATA TTTTACTGGT 360
ATATGTTGAT TTGGTTTTTG ACTTCTATAA GATCTTGATA AGATGCTCTC CCTCCTCAGA 420
GATGGTTAAG TCCTCAAATT CACCAGGCCA GGGTTTCTGT GACACTTCTA TTGTCTTGAA 480
TTTATGGCTG TTTGTTTTGA CTTGAGTATA TAAGGTAAGA TGTGCTTTAG GACGGGGGAG 540
ATCTTGTAAA AAGACACCCC ATTGCAGCAT CTCTGAGACT CATGCTGCAA TGTACTTCTC 600
TGGTCAGGTA TGCATCTATA ATTCTTTGAG TTATCTTTGA TTAATGGATG TCGTATTGTT 660
AGTCTCATCT CTGAATTGGC TTCCTGATGA TTTAATATGT AATTGGCAGA ATACAATTTT 720
ACCTGACAAA TAAAATGTTA AGTTTTGATT AATTCTGGAG TTTTGCGAAT TCATTGTATC 780
CAGTAGATAA GAGGAGTCTT CATTACCTTT ATTGTATGGC ATAA 824