EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33877 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:54433199-54435013 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:54433470-54433482TGTTTACATTGG+6.62
NEUROD2MA0668.1chr3:54434006-54434016ACCATATGGC-6.02
NFYAMA0060.3chr3:54434328-54434339AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr3:54434323-54434338CAATCAGCCAATCAG+6.94
Enhancer Sequence
TTTTAATGTT GTGATTTTCC TTGTGGCTTA TTGGTTTAGT TTTTGGCATC CAACTGTATA 60
CAAACTTGAC TTGCATGGCA AAAATACTCT GGAACCAGCA CTGCAGCAAG CAACAAGTCA 120
CTTTATAAGT TCACTTGCGT ACATTTAAAT AAAAAAATCA AACAATCTTT GGGCTTTACA 180
GGGATGTACT CTACTTCACT ATATCATCAT AGCAGAGCTC AAAAGCCAGT TCCCATGCTC 240
CAAAATGTGT GCTATTTGTG CGCATGTATT ATGTTTACAT TGGGTTTAAT TATGTGAACG 300
TCCTTGTTTG TAACCCAGGG CAGATACAGA CCCCTGTAAG GATTTTCAGG GGCCCAAAAA 360
GTGCTCCACC AAGGGGGCGT CAAGAGGAGT AGGGGGAGGA TTCTGCGGCT TCCTGGAGAT 420
TAGTCCTTTA TTTACAGAGG AGTCCTCAAG TGTCCTTAAC ACAACACAAT GCTAATCCAC 480
AAGTCCATTT TTACGCTTTT CTTTATTAAC TACATTACTG AGAAGACCAC GTTTTCCCTA 540
GGAGGGCTAG TCATTTGTAT GGTAACACGA GTACTATAAT GTGATTTAGC GAGGATTTTG 600
AGGTCCCGGC CAGTCAGGAC TTGCAGTCGA TTGTATCGGG GATTTAAAAC GTGTGAAACC 660
TACAGCAAGG CCGGTTTGTA CCAGTTTGAG GAATATGTAA TACAACAACA GACATATGAG 720
TGGGAAAGCG ACACCATCTC TCTTTTTTTT TTCCAGATAC TTTATCTTCA CAAACTCTAA 780
AGACGAAATC TGTTGTTTTG ACCTGTAACC ATATGGCAGC CATCAGTTCT GTGGCCCCTT 840
TGGCTTGGAA ACCCAACACT GACAGACGCT CACTATCACA TTCATTATCT GACTTTTGCT 900
GGATCAGAAG AAGGTACTTG AGTCTAGTTC CGGTGTTCTG CTTTGCTGAA AAGACCTGCA 960
TGGCTGTTTT GGATGCTGGC TCTCAGCATG TTTTTCCCAC CAGGATTCTT CTTAACTAAT 1020
TGACAACCAA CTTGGCCAGA ATGATCATAC TGGTTTAACA CCTTAGTTTT AAGTTAGTGT 1080
GATTTCACCA AGTAGGACAT GTTGATGACC CTGGAACAAC CTTCCAATCA GCCAATCAGA 1140
ATTAGGGAAT ATGTTTGCAG TTTATGGTAT ATTTAAGTTT ACACTGTTAA GGACATTTGT 1200
AAATTACACA GTATTTAACT GTAATATTAC TGTAAAAGTG TACTGTACGA CAGTTTGGAG 1260
TATGTTACTG TATTTTAAAC TGCATTGTGA AAATTACAGT ACTTTTTACA GTAAATATAT 1320
CCAATACTGC AAATACACAT TAATGTAAAT GCTGCTGTAA TTGCTGTAAT TATTTACTGT 1380
AAGTTACTGG GCGAACTGCT GCCGTAGATT TTACAGTAAA TTGTTAATAT TATACAATTA 1440
GGGTTATGTG CTTTTAGCAA TTTTTATTCA ACTATTATTC CCCTCTGATT TGGGAATAGT 1500
TTACAGTTAT GGTTGGGTTT AAAGGTGGAG ATTATGGATT ACATTTTCTA ACAGAAATGA 1560
TGTTCCTGGT TCAACATCGA TGTTAATCCA GGATCGTATC CTACTTGGCA AAATCACACC 1620
CAGTGTGTGA CTGATTTTAC CAAGTAGGAC GCGCTCCTGG ATTAACATCC TTAATGGTTC 1680
TGGAATAACA TTCCTAGTCC TATTTGAGGG GCAGTGAATG GGTCGGGTTA CACCTTGCCT 1740
ACACACTGCA CGCGAGCACT TAATAGCTCA CATTATAATC AGCAGAGCCG TCTGCACTTT 1800
AAGCACCTGA TGAA 1814