EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33868 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:54392395-54393857 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:54393815-54393832TTTTATTAATTAATGCA-6.19
ArxMA0874.1chr3:54393816-54393833TTTATTAATTAATGCAA-6.06
ArxMA0874.1chr3:54393815-54393832TTTTATTAATTAATGCA+6.13
IRF1MA0050.2chr3:54392771-54392792AATTACTCTCTCTTTCATTTC+6.08
POU6F1MA0628.1chr3:54393819-54393829ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:54393819-54393829ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AGTTAATTCG CATTTTTGGA TCTAAACATC GCTACTGTCA GGGAGGTGTC TTCACAAAAA 60
GTCTACATTT TTTGTACAAA TGAGATTGCA AAAACACATG ACGTGACTTT GCTTGATGAA 120
GCAACGAATT GCAGAGCTGG TGGAATCGCT CATGTTACTA TTATCAGATG CTTTCTTGAG 180
GTTTTCTTAC AACTTTCATT TTAGTTCTGT GTTTTATGTT TTACATATAT TGACAGGAAA 240
TGCGCATGCC ATTTCCGTCT AAACCACACT CTTGAGATGC CATCAATAGG TTTACAACTG 300
CTCCGGTATT TTACTTTTTC GACATACAAA TAAGAACTTT GCTGCAAATA AATCAGGGCC 360
TTTCCTACAC AACACCAATT ACTCTCTCTT TCATTTCAGT GCATCAGCTC TACCCCCGAA 420
GAACAAACTG ATATCAATCT ACACGTCTTC TCTTAATTAA TTGTGCTAAT TATCCTTTGT 480
TTAGGCTTCA TGTAAAGCTC AGGCACCCTT TCATGGCCAG GAGGCAGTGG CGGGGTGCCA 540
CACAGGCTGT GTTCTGCTTT AGTAATCCAG CGGGATTTGG AAAGTCTGGT ATACGTTTGT 600
CCTCCGCCGC ACGGGGGAGG GAGGAAACCG AGAGAGCTGC TCTTCCACTC AGCTTACATT 660
CAGCCACATT ATTTCCTCTC AGAACATTAG TCAATATTGT GTGGCTTAAG TCTATTCTTC 720
AGTGCTCAAT CTCTTTTCCT CCCCTGCGAG GCATACATAA ACAAAGGCCT ATTAGAACTC 780
AGGCCTCATG GTTTATATTT GTCATCTCTG TTTATTTGCT GATGCGTTTC TTAGCATGTG 840
GGCAAAAGGC AGCAGGAAAC GAAGAGCTGT GTATAAAGAA ACATGGTGAA GTGAGAAGCC 900
CACACATTCT GGACAGTGGA GGTTGTGCTG GATTACTTAA AAATGGGTTT TATTTAGAAT 960
ATTTACTATG GAAGTAGCAG AACACTTAAT TTTATAGTTA TGTGTAAACA CACTACCTTC 1020
CAAGAATATC AGAAAAGAAT TAAAAATAAC ATAAAGATGA TTATGAAATA AGACAGTGCT 1080
TAATGCTACA TATAAATGTG TTTACTAATA GGACTGCACA ATATATCGTT TCAGCATCGA 1140
TATCGCAACG TGTGCATCCG CAATAGCCAC ATCGCTGGAT CTGCAATGTC AATTAAGACT 1200
TATTGTCAAT TATGACTTAT TATTTTGGAT TTAATTGCAT TTCATTTTTC TGTTGTTTGC 1260
TCCTAAGCAT ATCAAGTGAG TACCAAGTGT CATTTTACAT TCTATATTTT ACATTTTTGT 1320
GTCCAACTTT CATTGAGACT TACCAGACAA AAACAAAACA CTTTTATTTC TTTCGATTGT 1380
ATTGTTTTTT CTTCACCCTA AAAATCTAGT TTAAAGTTCA TTTTATTAAT TAATGCAAGA 1440
AATTACCCCA AACATTCTTA AA 1462