EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33824 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:52896771-52898545 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:52898275-52898285ACCAATTAAC+6.02
FOXC2MA0846.1chr3:52898352-52898364TATGTAAACAAA+6.74
FOXK2MA1103.1chr3:52898353-52898364ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr3:52898353-52898364ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr3:52898350-52898367TATATGTAAACAAACTA+6.08
Hmx2MA0897.1chr3:52897211-52897228ATGTGATAATTGCTTGT-6.31
Hmx3MA0898.1chr3:52897211-52897228ATGTGATAATTGCTTGT-6.01
NEUROD1MA1109.1chr3:52898064-52898077GGACAGATGGCGG+7.22
Enhancer Sequence
GTATCACAGA GCAACAAACG TATAAATGCA TGCCTACATG CAAGGCAGGT GCTGTGGGTC 60
AAACTAATCA CTTGACGCAA AGGTAAAAAC CAACCTTAAT GGTCCAACAT TACCCAATGG 120
CTGACCGGCG GCTTATTGTG TCCCAACCTT AATCTCAACT TGTGTGTTTG TACCCGTAAT 180
TTACACTATA CTAATATCTC TGAATGAAAG CAGCAAACAA CACAAAAGAC AAAGGTGAAA 240
GAGTTTTTCA ATCTGTTTCT GAGCAAAAGG CAGTGAGGGT TTAAGTTCAG AAGGTGGTGG 300
ATCAACTTGG ACCCTGGATT CTCCCCTTCA CGTTCATTTG TCAACATTGT ATCAGCAGTT 360
GTGACCTCAT CTCTTTTGAA ATCTGTCACT CTCACATGGC ACTGCACGAC ACCCCTCCTT 420
TATTCTCCCT GGCAGTCAAC ATGTGATAAT TGCTTGTTAG CTTCTAATGC AAATCCGTCT 480
CCCTTTTGGG TTGGATTGAT TGTTTACAAG GGTGCTTTAA TGAGACCGAA TCAAACCCAC 540
ATGGACCTTA GAGCAGGCAC CATATTTAAT TTGACATTAA TATGAGGCTT TAAGAGATGG 600
AAGTACACCC TATTCATAAG GTCCTTGGTC ATACCATGTG TTTTTGCACC TCTGGAAATG 660
TTTTAATAGA TATGTGAACA GTTTGCATAC AATAATGTTT ATTGAAGTCC CTGCAATGCA 720
TTTAATTTTA GATACAAGCA GAACTATTGC TTCTGTCATG AACTTGGGGC ATTGAATTGT 780
GTTTTGATAT TGATTTTGCG TAGTTTTTCC TACTCATGTT AGCTAAAAGA TTTAATTATC 840
AGTTCCTTTG ATGGTCAGAT ATTCCACTTT AAATAATTTT AGAGCCAAAT TAATTTGTAT 900
TAAAACGTGT CTTTTCATCA GAAGTGCCTG ATCAATAATG GCAGAAATGT TTCTCTATAA 960
ACCCTCCTTG TAAATGACTC GAATGAGGAG TATTCAGCTT TTAAAGTCTC TGGAGAGTCT 1020
CTTGTTCATG TTGGCATCTA GGGCATTTCA CTTCGTGTTC TCCTGCCAGT TACAGGAGCT 1080
CAGTAACCAT TGCTCTTCCG TTCCACAGTT TTTCTAGCTC TCTTCCGAAG GAAAAATCTT 1140
TCTATTTTCC CCTCCACCAT GTGCCGAGTG TAGCCGCTGT GTAACTGGGT GGTCCTGAAC 1200
AGAAAATGAT ACAGAATGTA GTAAAGGTGG CAGAGAGGGG ATGAGAGGAA ATTAGCCTGA 1260
GTCATGATGA TGATAATGAT GAGGTGTGTG TGTGGACAGA TGGCGGGTTG ATGATGCCAT 1320
CGGGGGAGGA GACAGTCAAT GTAGATGGCA GGTCTTGAGA GGAATCAGAG GTCGTCTCAT 1380
TGGTGTGGAA ATCTGTGCTT AAAAGAAAAG TTCGCACAAA AATGTAAAAA TATAACCCAC 1440
TTACCCTGAT GTCATTCTAC ACTCATACGT TTCCATAAAG TGTAATTTAG GGATGCTCAT 1500
AACAACCAAT TAACCGTCAA CTGAAAGGAT GCATTTTCAA CTGATTAAAA GGGTATCAGT 1560
TGAATATAAA CATTGGTTGT ATATGTAAAC AAACTAAATT ATTATAAGCT ATAGTAGACT 1620
ACAGCCTACT TTACAAAAGG TATTGTATGC GCCTTGTCGT TGTCTCATGC CTAATATGAC 1680
CAGTTAACTG TTGATATTCA GTTAACAAGA AATGATCATT GGTTTAGAAA ATTAGCCAAA 1740
ATGAGCATCC CTAATGTAAT TCTTTGGTTC CTTT 1774