EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33795 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:52389018-52390520 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PPARGMA0066.1chr3:52389336-52389356GTCGGTCACTGTCACCACCT+6.23
RFX1MA0509.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC+6.73
RFX1MA0509.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC-6.75
RFX2MA0600.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC+7.03
RFX2MA0600.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC-7.06
RFX3MA0798.1chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC-7.1
RFX3MA0798.1chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC+7.29
RFX4MA0799.1chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC+6.73
RFX4MA0799.1chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC-6.79
RFX5MA0510.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC+7.03
RFX5MA0510.2chr3:52390163-52390179TGTTACCATGGAAACC-7
RREB1MA0073.1chr3:52389196-52389216TTTGGGGGGGTGGGGGGGGG-6.93
ZNF24MA1124.1chr3:52389599-52389612TAATGAATGAATG-7.12
ZNF384MA1125.1chr3:52390256-52390268AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:52390257-52390269AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:52390258-52390270AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:52390259-52390271AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:52390260-52390272AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:52390261-52390273AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF740MA0753.2chr3:52389205-52389218GTGGGGGGGGGGT-6.32
Enhancer Sequence
GAGATTCAGT TCGATTCACT CGTTGCAGAC AGATGGATAA TGAACTGTTT CTTATAGGGA 60
ACTGCTAACA GATAACGATA GACAGAGAGA AAGAATGAAC GACTATTTTT TTAAAGAATC 120
GTTTGTCAAT TCATTTGTAA TGCATGGATA GAGCAGTTTT TTTGTTTTTG TTTTTTTTTT 180
TGGGGGGGTG GGGGGGGGGT TATGGAATTA GTTCTTGATT TATTCGTGGC AGGATCTTTA 240
GGTTTTTGGT CATATTTATA AATATTTTTG ACTCTCTCGG AAAGAAAATA TTTGCTAAGT 300
GAATGATTTC TTGACTTAGT CGGTCACTGT CACCACCTAT TGACGAACAG GTAACCTGTA 360
GAAAGTGTCA CTGAGTGAAT GGATTTAGTG AATGAACCCG TTGAACAGAA ATCCCGAATA 420
CTATATACTA CAGTAATGCC CTCCTGGTGT AAGGTTAATG TATTGTTCAA GGGCACAGTC 480
GTGGTATGGT AACGCCCACT GCAGACACTG ACTGAACCTT CAGCCCAGAC AGAGACCAGA 540
CGTATGTTAC TCGTCAGATC ATTCACCATA AACGAGTGCA TTAATGAATG AATGAGGCAT 600
ATAATGCATA ATAAAATCAC CTGTAAGTCC CGTGCGGCTG AACGGAGCTT CTGTCCCGTT 660
CATCTTTGCA GCGGTTTTTC GAGCAGACTG AAGTTCGCTC TCCAGAAAAT GGCATTTCTT 720
TTTCAGAGAT TCATTTTCGT TTGTACATCG TGAAATCTCC AACCGCAGCA ACAATGAATT 780
CTCCTCGAAT AGTTTGCTTA TTTCAACAAC GGCGCTTTTC GCTAACATTT CCAGTATGGA 840
TGTTAACTGC GTCTGAAAAT CAGCTGTATT CATGACGTTC ATTGTTTACG GGACCATTAA 900
TCAGTGATGT ATATTGTAAA CATCCGTCCC CCGCACTGCT AACGAGTAAT CTATAAGTGC 960
AGAGCTGCCT TTGTATTCTC AACAAACAAC AGCACTGTAT TCAGTGTATT TCTGAGAACA 1020
GAATCATAGC ATATCTAGCA ATTTGCAGAA CAGGATCATG GGATGAATTA CCGTAAACTG 1080
CTATATAGAG CGGACGCATC ATTTATAATT TGCATTGGTC TCGTCTAAAA CGGTTACCGG 1140
CAAACTGTTA CCATGGAAAC CCCCTAGTTT TCATCATTCT AAGCGTAATT TTATAACACA 1200
TAAATACATA TTCTAAAACA TTTTTGCTCA CACACATGAA AAAAAAAAAA AAAAAGAGTA 1260
TTTATTTTGT CCTAAAAAGG GATGCCACTG TGTTTAGACA TAGATAGTTG CCAAGACATT 1320
GCTATGTGGT TTCTGGCAGT CTCGTTGGTT GCTCACATAT ATATTTACAT GTAGGTCTAT 1380
AGGTGGCTCA TCTCAAGTAA ACAGTGTTTG ATGTTCCTAA ATCTGGCTTG GGTTGTTTTT 1440
TAAGGTAAGC CTCCATCAAT TAATTTTGTT TAACAATAAG TCCAAAAACT AAAAAATGAC 1500
AA 1502