EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33724 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:49301180-49302264 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:49301485-49301497GATTATTTGTTT+6.07
IRF1MA0050.2chr3:49302143-49302164TAAGGGAAAGTGAAAGGGGAA-7.14
IRF2MA0051.1chr3:49302147-49302165GGAAAGTGAAAGGGGAAG+6.51
Klf12MA0742.1chr3:49301665-49301680TTTGTGGGCGTGGTC-6.59
MEF2CMA0497.1chr3:49302172-49302187GATACAAAAATAGAA+6.41
SP3MA0746.2chr3:49301667-49301680TGTGGGCGTGGTC-6.21
Enhancer Sequence
TGCATGCGCT CGTCATCAGA GTCGCGCTCT TCCTCTGAGG AGAAGGTAAA TTCTTTGTAG 60
CTGTTTAGTA CATCGCTTCT TCACCCGTGT AGTGTGTCAT TGTGCAAACA AAAATAAGTA 120
ACTATAATAA AGCTTGTCAT TTGATGCCAT GTCTTGGGGA GCGAGTACAT TATCACCTGG 180
CTGGCTCACC TCAGTTCATT TCCATATGAA CTGCGCCTTC ACTGCGGGCG GGATCACGTT 240
CGCTGTAATG AGGCGACAGG AGAATCAGTA CCAGCCCTTA CTTTTATACG AATTACATGA 300
AAGAAGATTA TTTGTTTTCT TGAATTGGTT AATGCAAAAG TAGACATATC AAGCTTTCTT 360
TAGAAACATC TTACATGTTT CTTTGTCGAG TATTTGCTGA GTTTCAGTTC ATTTTAATGA 420
CGTGTTTTTC CTGACACAGT CTACTGTTGC GCGCTTCTCA TGCAGACTGT TTGTAATGTC 480
AAAGCTTTGT GGGCGTGGTC GCATTAACTC TAATGAGCTC AGACTGTAAA GCTAGACATA 540
GTGTTGGTTT TATACTGATT ACTTTATCAA ACAATATTTG TTTTCAACAT GCATAGCTGC 600
GTTTATAAGT AGACACTTCA AGCTTTAAAA AGATATGTGT CTCGTGTCTG GGTGTTTTGT 660
TTTCGCGGAG TTTCAGCGTA TTTTACTGAA GCGTTTCTAA AAACAGTTAA CGGAGAGAGA 720
AAAGACAGAA TGCCTACACT GTTTATTATC CTTGTTTTGC AAAAGCACAC ACATTTGTTT 780
TTGTTGTGAG TGTACTCATT TAAAAGTATA CACCTAACAG ATTCAATTGA TGTAATGATC 840
TTATCTGTAT GATCAAAACT GAAAGTGTAA TTTAGGTTCA TTTCAGCTCA ATGAGGTAAA 900
AACTTGTCAG AACGCGTATA TGCGGTCTTC AACCCCAGGG GGTTAATCCT CAGTTGCAAG 960
GGCTAAGGGA AAGTGAAAGG GGAAGGAGTA GGGATACAAA AATAGAATTG GGATTGGGCT 1020
TAATACTCTC TCCTCTACAG CACTGCTAGC ACAACCTCTA GCAGAGAGGA GCCACGCCAC 1080
ATAT 1084