EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33693 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:48620139-48621849 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr3:48620590-48620605TCACCTTTGACCTGT-6.17
Nr2f6MA0677.1chr3:48620590-48620604TCACCTTTGACCTG-6.16
PAX6MA0069.1chr3:48620930-48620944CAGCCATGCGTGAA-6.31
RXRBMA0855.1chr3:48620590-48620604TCACCTTTGACCTG-6.01
RXRGMA0856.1chr3:48620590-48620604TCACCTTTGACCTG-6.25
RxraMA0512.2chr3:48620590-48620604TCACCTTTGACCTG-6.06
Sox3MA0514.1chr3:48621226-48621236CCTTTGTTTT+6.02
TFAP2AMA0003.3chr3:48621238-48621249AGCCTCAGGCA+6.32
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr3:48621238-48621249AGCCTCAGGCA+6.62
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr3:48621238-48621249AGCCTCAGGCA+6.62
Enhancer Sequence
GTGTAAACTC TACCTCCACA GAAGAACCTG GGGCTCTGTT CGCTTCATTT TACCAGTGAT 60
TTAATTACAA ACAAGGAACC GTGTCATTAA ATTTTTTTAT TTTTATAATT TTTTTGAATG 120
ATCTAAAACC ACACAGTTTG TGTGCAGTGC ACATTTGATG TGGTAAGATG AACGCAAAAG 180
CACCAGGGTT TGATGGAATC AAGTGAGTGT GAAATCAAAC CAGTGTTGTG AAAGACATTC 240
TCAGATTAAG AATATGGTTT TGTTTTTGTT TTGTTTTTTG CCTGATGACC CACTTTTCTC 300
CTTTTTATTA TCTTTTAAAA GAAACTATTT AAGCTTTCAC AAAGATTTGA ATGTAACCAC 360
TTTTCATAAC TAACTTTACC ATGATAATGC CCATGTAGAC CCCAGCTATA AAGTGAAATT 420
TCTGTCATGT TTCCTTTTTT GTTCAACTGT TTCACCTTTG ACCTGTTTTC CATGAGGTTG 480
TTCTGAGTGC TCCATGGCAG AGTGCATTAG TTTCTATGGT GAACACCACC TGACCGGCCA 540
GGTGCTGTCT GTCAGCAGGT CATTCTGGAA CGAGAGAGCT GCTGCTGCCT TTTTTTCATA 600
TGTTAAATAT GCACCACGTA CACCACAGGC TGCAAGCCAT TGTTGGGGAA TGACACTTTT 660
TGTCATGTTC CCCACTGTTA TAGAATTAGC AGAGGCTTTT GGAAGTTAAT TCTCATTAAA 720
TCAGTTGTGC TCTCAGTTCA ATTTCCCAGG TTGTAGGCAG GTATTGAATT GGCCTCATGT 780
GGATGAGGCT CCAGCCATGC GTGAAATGGT CAAATAATGT TTAATGAATT TTCCGCTAAT 840
ATCTGATCAA GGCCATGGCG GCTTATTGTA TTTGCTTGTT GAACACAGTT CCAGTTGGAG 900
CAGAGAGACT CGGGAGCTGC ATTAATCTTA ATGGTCTGTC AGGAAAGGTT GTCTTCCTTT 960
GTATAAGTAT GCATGTGTTC TACATAGATT AGCATAGTAC TCTGCTTTGG TTTTGGCAGA 1020
GTGATCACAA TGCATTTCAC AAAGGTACTG GGCCATGCTT TTGTTTTCCT TCTCTTCCTT 1080
TCTTTCCCCT TTGTTTTGTA GCCTCAGGCA GCAAACTGTG GCCGCTCATA AGACTGACTT 1140
AACGAACTTC ATTTATCAAT AGAGTGAAGA ATCATTGTGA AAGGAATAGA AATGTTTCAT 1200
TTACAGTCAT CTTGGTTATA TTTGAGAAAT TATACACTAA ACTTTGACGT CATGACAACC 1260
AATGAAAATA GGTTTGGTAT AAAATTTCAG TAACCGAAAT GTAGGACTAC TGTACTCCTA 1320
CTAGTACCGC AGATTGTACT TCAGTAGTGG TGGTGGTATA AGTAATAACA ATTTTATTAA 1380
GAATAAATTA ATAATGGCCC CTTTCCACTG AGTGGTACTG TTTGGTTTGG TATGCTTTTG 1440
GGCTCAAATG TTCTAAAATC TCTTAAAACG GTCAGACACA GGCCTTAAAA GCGCATGCAA 1500
ATTATAAACC TTTACTCTAG TGTCATTTAA CAGTAGCTTT GTTTCCATCC AAAGATGCTA 1560
ATTAAATTTA GCAAAACTGG AATGTGAATA AAAGCAGCGT TTCCATCCAA TGAGCCAAGG 1620
AGAACAAAAT CGTCACCTCC TGATTAGCTG GTGGCAAATA AGTAAAAATG GAATTTGCTG 1680
CGGTAAGAGA AGCTGTGTGA ATCTTTTCTT 1710