EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33669 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:47856734-47858083 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ETS2MA1484.1chr3:47857464-47857474ACTTCCGGTC-6.02
LMX1BMA0703.2chr3:47857282-47857293TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr3:47857279-47857292TAATTAATTAAAT+6
SPIBMA0081.2chr3:47857709-47857721CACTTCCGCATT-7.22
Sox3MA0514.1chr3:47857058-47857068AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:47857885-47857897TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47857886-47857898TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47857887-47857899TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47857888-47857900TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47857889-47857901TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:47857890-47857902TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr3:47857891-47857903TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TTTTATTCCC CCTGAAACTT TCAAGTACGT CACAGTCTTT TTTGCATATG TGAGTTGATG 60
CATTACTCCT TTGTCTTAGG TCTGAATGGC GGAGCAGGGG GTATATGGGA CTTTATGAGT 120
GGCAGCTTCT CTCCCAGCCC GTCTCCAGTG TTCAGCAGCC TTACTTCCAA CACGGTCGGC 180
TCCAGCAGCG CAGACATCGG CCGACTCCTC CGAGAACTGG ATGAAGCCAA GCGTAAGATC 240
AAGCAGTGGG AGGAGGCCTG GCACCAAGTC AAACAGGTCA GATCTGCTCG CTTTTTACAG 300
ACCTCATAAG ATGAGTGACG CTTAAAAACA AAGGCTTTTA TTCGGGAGCC ATTTACGGTC 360
CTCTGAGAGA TTCAAGTCAA CTTTTGTTAT TGAAAATAGT GGCTGACACC TCAACGCCTC 420
AGGGTATATG CAGTGCTGAA GTGATTATGC ATATTTTTTT AGGCCACCTA TTGCCTCCCT 480
AGTCTCTCAA CTGAAAACCA ATGAGATTGT TGCATTGTTC TTGGGATTAA TAAGCTCTGT 540
GAGCTTAATT AATTAAATTG ATTAATTATA TAATTCTTAC ATGTTTTGTT CATCAAGATA 600
GTCTTTACCA ATGAAGACAA TATTTATAGT TGTTTTAGAG CATGAATTAC AGTTGGCAGA 660
GCTAACGTCA GCATCTACCT TATTGTTTGC ATATGAACAG GCACAGCCAT TTGAGTCTTT 720
TTGGCTCGAG ACTTCCGGTC TCATTCACTT CCCCTCATTT TAGACATTAA AAACAGCTTG 780
TTACGCTGCT TGATGTTGCC AACTGTTTCT TTTTTAATTA TATTATTCTG CTTCTCTTCT 840
CAAAGTCAAA GTGAAGTCAT GCACGCACTT GTTTGTAGAG CGAGTAGTTT GACTGTTTTC 900
TACCGTTTAT TATTCCTAGT CATTCCTCCT ATAGGCAACT GAATTGGAAG TTCTAAACAG 960
CTGCAAAAAC GAGCACACTT CCGCATTGAA GAATAAGGTC AATACTCTAT ATTCATAATA 1020
AAGTCTAAGT TAAATTCATA ATTTTAAACA CAATAAGGTT CTGAAAGTGC TCTAAATGCT 1080
CTGATAAGAA GCCATTTGTT CTCATAACAT CTACATTAGA ATTTTCCGAA TCAATTAAAA 1140
TATGCAAACT CTTTTTTTTT TTTTTTAAAC CAAGCCCTAT TACCAACTAA AGCCAGGGTA 1200
TCCGTGGTAT TGTAAAGGGT AGTAAATGAA ATATGCCAAC ATATAGGGCA TTAAAAAGAA 1260
TTCAAAAGTA AAAAACGTCA TCGGACGAGG CATTTTTTTC GAGCCCAATT TTTTTTAGAA 1320
AAATTTTAAA TTTGTGTTAA GTGCAGGCC 1349