EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33654 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:47439467-47440551 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr3:47439830-47439841GTTTTATTGGC-6.14
HOXB13MA0901.2chr3:47439830-47439841GTTTTATTGGC-6.14
HOXD13MA0909.2chr3:47439830-47439841GTTTTATTGGC-6.14
SOX10MA0442.2chr3:47439824-47439835TGCTTTGTTTT-6.02
Sox11MA0869.1chr3:47439851-47439866AATAATTTCAGTGTA+6.26
Enhancer Sequence
AATGTATAAG GGGTACTCAG AATGTAATCA GAATGAGCCT GGGTTATTAA AGGTAGTTAG 60
CTACATGTAC AGTACAGAAC GGCTTGTTTG AAACAGTAAC ATGACTGTAC ATTAATTATA 120
AGATTACGGT ATCTTCAAGC TGACAACCTG CATTTTAAAA AGCAGCTTCC CAAAGATTTC 180
CCAACCCATT CCACCATTCA AGCCAGGTGC TGCGATTTCA GCACAGCTGT GAAATCGATG 240
AAAGTAAATA ACCATTGGAT GCTTCCCCCA TGCCAACCTG CCTGCATGCA GGTAAAAGCG 300
TTTAGAGCTT CTTCCAGCCA TTTGGAAATC CTTCGCTGGG AAAAGATGCC CGGCTGGTGC 360
TTTGTTTTAT TGGCTCAGCC AAAGAATAAT TTCAGTGTAC TGAGAGGCAC CTCACACCAG 420
CAGCTACGTA ATTAATGTGT CCGAGCCTAT TTATAGTACA GAGGGAAAGG CTGTGGAGAC 480
GTGGGTGGTG TCGATGGGTG AGGGGTATGG ATGGTGGTGG GATACAAGGA ATGAGATGGA 540
GGAAGGGAAA AGTGACACTT CATTGTGATT TCTGAAGCTT TTTTCTTGGG CTGCAAATAG 600
CACAATGTCC TGAGAGAGGG TCTGATGTAG TTAAACACAC AACTTGAAAT ATCTAATCTT 660
CCGAGGGCTT TCTAATCTAT ATTTGCAGAT CAATTTCTGC TTGTGCACAG AAAAACCCCA 720
GCAAACACTT GTGCAAAGGG GTTGAGAATC ATTCATCAGA GTTCAACAGT TATCAGATGT 780
GAGTATCAAG TTTTGCTATT AGAGGTAGAA ATGCAGCTGA TATGGTAATC TGAATGTGGA 840
TACCTCCATC TCAGAAAATA TGGTTTGGAA GAATTCATAT TAGATGCTTT CACACAAGAG 900
GACATTTTTC ATTTTACCAT GTTCACACTG CAGAAACCTG GAACAGATTT ATTTCTAAGT 960
TAGCTCCAAC TTCAAATTAG GCTTTAAATT CAGCCCAACA TGAAATAGCA GACATTAACA 1020
TTCAGAAAGC TAATCTTAGC AGCATTTACC TGTTGCTTTT GCCTTCAGCA TTGCTTTCTT 1080
TTCT 1084