EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33590 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:44713730-44714732 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:44713782-44713799TGAACTAATTAATTAAA+6.24
FOXC2MA0846.1chr3:44713927-44713939AAAGTAAACATA+6.11
Lhx3MA0135.1chr3:44713784-44713797AACTAATTAATTA-6.22
Lhx3MA0135.1chr3:44713787-44713800TAATTAATTAAAT+6
mix-aMA0621.1chr3:44713785-44713796ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
AATTTTAAAA GTATTTATTT GAAAGAAAGA AACAAAAAAT ATTGTGTGTA ATTGAACTAA 60
TTAATTAAAT GTAAGTTAAA GATTTTATTT TGAGTCTCAA TTCTGACCTA AAAATACTGA 120
TCACAACTGA TACACAAATT GATACACAAA CTGATATCGT TAGTTTATAT GCTGGGTTCC 180
ACAAAATGTA TTGAATCAAA GTAAACATAT TATTTTTTAT TATTATTAAT TTAGTTGAAT 240
TGAACATAAA ACAATTAGGT TGTCCCCCTA GAAATCTCAA CACTAAAAGC ATGAGTACAT 300
TCCATCGAGC TGTTGCATAA GCAGACAGAA AGACAGTAAA TCCCTGCTGT AAAGTGCTCT 360
TCTATGACGA CCGTCTTCTC AGCATCTCCA GCTATCCTGA GGGAACTTCA AACAGCACAA 420
AGACTTTAAA GGTACAAACA ACAGCCTTTG AACGTGCCAT ACCTGATAGC AGATAATGTA 480
AACACAGGTT TACTGAGAGC GCTTCAAAAA CAAGCTCAAG AGCCAAGACG AGCCTCACTT 540
CCCTCTAGAC AAAACAAGGT AATGACAGGC ATTTCACACA GCAGGGATCT CTCATTTAAC 600
CCTGTGCTGC TGCTGAGTTT TATGAGGCTC ACAGAGTGCA GTTTACTCTT AAACTCGGCC 660
TTGTAAAGAC TGTGCGTTAG CATGGTTTTG TTCTGTTGTT GTTGCTTTGC TAAAATGTAC 720
TCATGTACCC ATGCATTAAT GGACCACAAA ACATATACAG CAAGTTTCAG TTTTTGGGAA 780
TTAAGATCTA TATATCATCT AAAATCTGAA AAAAAAAAAG GATTTCCATT GACATACACT 840
TGAAGCAGTT GAAGTCAGAA TTTTTAGCCC TTCTAAATTA GCCTAATATA CAGTTGAAGT 900
CAGAATTATT AGGCCCCCTG AATTATTAGA CCCCCTGTTT ATTTTTTTTC CCTAATTTCT 960
GTGTAACGGA GTTAAGATTT TTATTCAGCA CATTTCTAAA CA 1002