EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33536 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:43009567-43011437 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr3:43010664-43010678TGATGATGTCATAA-7.06
Alx1MA0854.1chr3:43009651-43009668TGAATTAATTAATCTAC+6.72
ArxMA0874.1chr3:43009651-43009668TGAATTAATTAATCTAC-6.57
FOXB1MA0845.1chr3:43010248-43010259ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr3:43010248-43010259ATATTTACATA-6.62
JUNMA0488.1chr3:43010663-43010676TTGATGATGTCAT+6.92
JUND(var.2)MA0492.1chr3:43010662-43010677ATTGATGATGTCATA+7.19
Lhx3MA0135.1chr3:43009652-43009665GAATTAATTAATC+6.54
POU6F1MA0628.1chr3:43009654-43009664ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:43009654-43009664ATTAATTAAT-6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr3:43011232-43011246TTGACCTACATTTA-6.84
ZNF24MA1124.1chr3:43009644-43009657GAATGAATGAATT-7.22
Enhancer Sequence
TATCAGTAGT GTATGAGTTA GCAGTGCATT CTGCTGTGGA AACCCTTGAT GAATAAAGGG 60
AAGTTGAAAC TGAAGGAGAA TGAATGAATT AATTAATCTA CAAACTAGAT ACTACATAAT 120
CAACCTCGCA CTTTGTCTGA GAAACCCGGA AGAGTGGTTG TCGTCACTGT CAGTGTGACG 180
TCACTGACTT TTAATACATC CCAAAGAAGG CACTACTACA ATTTCAGCAA CAGAGGGCGA 240
CATAGAGCAA CAAATCTGTG CCGTAATCCT ACAGGTTTGA TTGCAGATTA ATAAATCACA 300
TATTTTCATA CATTTAAAAA CGCTCGTATG TCTGGCTCCT GACATTTTCG TGTAAGCATC 360
ACTCATACAC AACTATGTAT AATATATGCT TAAATACATA ATAGAAATAA GTGTTGTCTT 420
CACATTTAGC TAACATGACA TTACGCAAGT AAATGAATGA AAACTATGAC TAAAATCTAT 480
AAGAGGAAAA TAAAAAGGCT GCAAAGTAAA CTCGGTCATA TAACCACTCT GGGGTTTCTA 540
AGAACGTCCC TTCCTAGTTT CTAAATTTGG AAATGACTTC TAGGAAAAGA GAAACTGCCA 600
GCTCCATATG TTTTATCTTC CACGTGTTTA GACGTCGCTC CCTTTTAAAG CAAAAGGAAA 660
AAAGGCAGCG AGTCAGAGTA GATATTTACA TACTGACACC CATTGAAGAT CATTAATAGA 720
CTAAATGGTG AGTGTCGGCG GCTCGGGGTT TTGCGCACAA TTGGCGTGCG CTGCTGAAAA 780
TGGCATCTCC CCCATGCGCG GCCCCTGCTT TACCTAGTAG CGTGACCATG AAGCAATGCA 840
CGAGCAGAGA GATCTTAACA TGCACAGAGT CAGTCTGGCT CCTCGAGACG CCTGCTCATC 900
TCGCCAGCAG GAGCACGTAC GGCGTGCACT TAAAGAAGAC AACATCTGAT TCAAGCCGGC 960
CAGATGTTTC ATTCCGTCGC GCTGCGCTTT ATTCGTGGCG AGGTAAGTTT CCAGATATGT 1020
TACATGGATG TGCGCGCGTT TTCAGCGGCA GGTGTGATCG GAATCGGGGC AGCGGGTAGA 1080
ATACTTATAA ATTCCATTGA TGATGTCATA ATAGGCATTC TGCTTAGCCG TTACAATGGG 1140
GGAATTGGCG TTCGAATGGA AAAGGAGAAT AGCGGATAGA GATCGCCAAC GTGATGTGCG 1200
TTCTTTTAAA GCAACAGCCT GATGTTTTAG TCGCATATTG CTGCTTTTGG CGGGTATTGC 1260
TCGCAGACAG AGGCAGACAG ATTGTGTCTG AGAGAGTACC TGAACTCTCT GGGGAGTCGA 1320
ACACACTGTC TGGGACTCAA TTGACGCCCG GCTGTCTCTC TTAACACAAA GATCTTGATG 1380
GAGCTTTAGA AAGCCTTCAT GCTTGAAAAC AGGTGAAGTT CGATTGATTT TGTAGCCGGT 1440
TTAATTATGT GTGTGATTTT TTTTTTCCTT CACTTGGTGC CATTACCGGA GAAGGTCACT 1500
ATTGCTTTGA TTAGTGGTCA AATATTTTAG AGAAAGACAT TGGACATGCG TGGTGTTTGT 1560
CATGTTCAAG TTTATTTGTG TCACGCGTTC CGCAATATAG GCTACGGCGT TTGATAGAGG 1620
CAGACCAGAT ATATTCTGTT CCTCTTTTAA TTCATTGATT GTAAATTGAC CTACATTTAG 1680
TTTTCCCCAC TGAATTAGGG TAAAATTTAG TCTGGACAAA GAGCCGGATT GAGTCAGAAA 1740
TATCCTTGAA AGTGGCCATA CTTAAGAGAT TACAAAAGAA AGTTTATTGA GAACTAGAAC 1800
CAAAAATGGA TTTTGATATG TCTTTAATAC TTACTGACTT ATTGGCATGT CAACTCGGGA 1860
AAATATTTTT 1870