EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33486 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:41931901-41934367 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr3:41931978-41931988TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr3:41931978-41931988TCTAATTAAA+6.02
BHLHE40MA0464.2chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
FOXC2MA0846.1chr3:41933806-41933818TTTATTTACTTA-6.07
HNF1AMA0046.2chr3:41932074-41932089AATTAATCATTAAAA+6.58
MAFFMA0495.3chr3:41932402-41932417ATGCAGACTCAGCAT+6.69
MAFFMA0495.3chr3:41932402-41932417ATGCAGACTCAGCAT-6.75
MAFGMA0659.1chr3:41932399-41932420GTAATGCAGACTCAGCATTGC+6.35
MAFGMA0659.1chr3:41932399-41932420GTAATGCAGACTCAGCATTGC-6.48
MAFKMA0496.2chr3:41932400-41932419TAATGCAGACTCAGCATTG+6.43
MAFKMA0496.2chr3:41932400-41932419TAATGCAGACTCAGCATTG-6.54
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
TBX19MA0804.1chr3:41932891-41932911GTTAACACCTACCTGCTAAT-6.26
TFEBMA0692.1chr3:41933047-41933057GTCACGTGAT-6.02
USF2MA0526.2chr3:41933043-41933059GCTGGTCACGTGATGA+6.16
Enhancer Sequence
TTCAGTTAGC CTAATTGTTT TAAAAAACGT AAGTGAATTG AACATAAAAC GATTAAGTCG 60
TCCGACTAAC ACATTTTTCT AATTAAATTG TGTTGATTCA ACTCATTTTA AATAAGCAGT 120
TTGAACAAGC AGCAACGTAT AATACTGTCT TTGTTGTTTA AACAATACAA TAAAATTAAT 180
CATTAAAAAA TGTTAAAACG GTACAATTTC TTATGCCTGA ATGCTTTTAA AATCCTCATA 240
CAATCACAGG CCTCAAAAAA CACTTGCAAA ATGACAGTCT GATCTCACAA GAAAATGTAA 300
GTATTTTACG TTTTGTCAGT TTAGTGGCTA ATTCGTACAA GTTTAATCGT ACGAAGATAT 360
ACGATTTTAA AAAGGAGGCT TGGCACCCAA CCGTCATTAG GGATATGCAA ATCGTACTAA 420
ACTAGATTGC ACAAATTCAT AAGAATAAGC CACTAAATTA AAACATTACG AATTGCCATT 480
AGACTGTGTT GATTGATTGT AATGCAGACT CAGCATTGCA TATTCTGCGA CGTGACTATT 540
GCAAATGATC ACAAGGCGAA ACCGATGCTA AAACACTATA TTGTGCAGTC CTAAAGAGAA 600
GGGTGTTCCT GTAGTAGTTT TGTTTCATTC AAGCAGATCA TTCCCACTAA GAGTAAAATC 660
TTGTTGTGCT TAAAGTCTGA AATTTACATA CTGACATCCC AAAACATCAC TTTCTGCTGA 720
TTTAATTTTC CTCAGGGAGC CATATAGCTT ACACATTGTC ATGAAAAAGA ATGAGGCTCT 780
TTTCATTTGC AGTTGGAGCA GCAAGGGGCC AAATCTGGGT CAGAGATTTC TTTGGGAAAC 840
CAACAGTAAT CTGGGGAGGA GACCGAAACA CTTGCAGAGA GCATGTCAAA AGCATCTCAG 900
CCTTTGAAGG CAGAATGGAT GCCAATAAAC CTTCCCACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAG GAAGTCAGTA GTTAACACCT ACCTGCTAAT GTAAACTGTA 1020
AAAGCAACAG AGCCACCCAG ATCAGATTTG GAGTTGAACA AAAGCTGAGA CATTAATATT 1080
TCAAATGGGG TTTGTGTTTA CATCATTCAA TGAATGGTTC CTTCACAAAT CCTTCATAAC 1140
CAGCTGGTCA CGTGATGAAT TTATTGGCAG TTTTCCACAG TGAGAGACAG CTTGTGTTTC 1200
CTGCCTCGTC AGTCTGTGTC GCACCATGCA AACACGCTGA CAAAACAGAT TAGCAGCATC 1260
CCTGCTCTCG TTTCCTGTGA GCCCAACAAC ATCCCTAGCA TGACACGCTA CAATGACTCA 1320
AACGATTCGA CAATCATCAG CGCTACGATT AGCAAATGTG AAAATGTTTC CGTCTCTTCC 1380
CCCGTGACAC GAAGAGGCCG GTCACGAATT TCTCCAGCCT CCCCCACAGC CAGCCTGGGG 1440
AGTAGGTGTG GGAGTGGGAA AGCATGCTGG GGTTTTGTTT CTCAAATTTG CACTTCATGT 1500
CGTGCTTGAG CCCACATTCT CACTACACGA AGAGCGGACT TTAACCAGCA AAACAAATAA 1560
GCAACACTAC TCTGGTGTTT TTAATAAAGT TGTTGAAGAC TAAACACTTT TATTTAACTC 1620
AAGTCAAATT CTTGTGTTGT GAAGCTTAAA ATTATCATAG AATTTACAAA TTTAGTCTAC 1680
AGTCTTGTTC TGGCAACCAA AAGCTATCAC TTTTCTTAAA CACAGAAAAA AAATGGCATG 1740
AAATATTTAG TCCCCTTTAA ACCACTGTAT CTTTACCCCT GGGAAGAAGG TGAGTTTTAG 1800
ACAATTGTAA CAGAAGGATG ATAAATTAGA GACAAATTAA TACAAAAATA TATATTTTTA 1860
TCATTTATTT ATTTACTGGT GCATTAATTT AATTTATTTT TTAAATTTAT TTACTTATTT 1920
ATTTGATGGA AGAATCTATG GGGAAGGGTA TGCATGTCAT TTCCCTTAGT GGTCCATTGT 1980
TATTCGCAGA AACAGCAATA GGCAAAATCT AAGAAGCAAT CAGCTTTATT TTTTACAATT 2040
ATTATAGATG TTTTAAGGCT GTAAAACCCC TCACTACACA CTTTATACAC TTTTCTCAGG 2100
CAGCCATTAA CATTTTTACA ATTTTCTCTG GTTTAAACAC TCTCAAAGTT TAAACCTTTG 2160
TAGAAAGATA AGTCCAGTAT TATAGAATGA AACCAAACAT CAAAACCATT TGATCTTCAT 2220
TTATTTATTC CATAATGGCG CCCTACCGCA TAACCTCTAT CTACCTCTAG CAAGTCCAGA 2280
AGATGGTTAG CATTTTTCTC TGCCTTTTGG GTGCTACCAC AGGTGTCATT AACAGTGCAG 2340
AATGTTTTGT TGATATTGTG GAAAGAAAAT TTGCAAACAT ACAGTTCAGC ACTGTAAAGG 2400
AGACAAAGCA TGGAGGACAT TGATTGACAA TGGTCTACAG CCAGTCAGGA CTCAGAACAC 2460
AATGTG 2466