EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33483 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:41897709-41898731 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:41898611-41898622TTAATTAAAAT-6.62
NFYAMA0060.3chr3:41897814-41897825AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr3:41897809-41897824CTATCAGCCAATCAG+6.23
NR2F1MA0017.2chr3:41897760-41897773CAAGGGTCAAGAG+6.3
SOX10MA0442.2chr3:41897926-41897937AAAACAAAGAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr3:41898174-41898186ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:41898173-41898185AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
AGATTACTAT GGTATAAATA CAGCGCTAGA ACATACAAGC GGAGTAATAC ACAAGGGTCA 60
AGAGGCTGTA TGAGTGCTGT TATTACAGAA TATCACACAG CTATCAGCCA ATCAGATTGG 120
AGAACCAGAA CATTTGTTGA AATCAAAATA TCATACAAAC CTGAAAAGGC ATTCCCACCC 180
ATAATATATT AATAAGTCAA CGCAAAATGC CAGCCATAAA ACAAAGAAAA AGGTCAGTAG 240
TGAGATCTAC AGGGTCTGAA GCATCAAATC CTACAAAGAC ATCTCAGATA ACAGTTTTAC 300
TGAGAGATGG GAAGAGATTG TGCAGACTTG AGCAAGATCT GACCTGAGGA TGGATCAATC 360
AACGCTGGGC CAATATAACT TTTATCCTCT ATAATAGAAA GCTCAATCTG CTAGAAACCC 420
TCTATTCTTA GCAAATGGTT GGTCTATACT ACAAACAAAT AAATAATAAA AAAAAAATCC 480
ACATGACTCT ACAAAATCTA TTGCTGATGC TGGGAGGCAG ACGTAAGTTG TGTAACATAA 540
AGCATAAGTA ATGACCTGCG AGGTCTGATC GATGTGAATG GGGTTAAACG CTCCTTCGAG 600
AATAACACTC CATTGACTGG ACAGACCGCA CTGGGCTTTC TCATTACTCA TGCTTGCCCT 660
GTTGCGCCCT TCCCCCCTAA AGCACAGCTA TCCTGAATCA CCAGCCATTT GGTTAAGTGG 720
AGTGTCACAT GGTTAAGATG AGACCGGTTT AGTCACTAAG TGCCTGAACT TGTGTTCTTG 780
GCAAAACAAA TGGCTCTCAT GTGCCAATTC ATTTAAAGAG GAGTTAACTC AAGTAAAGGT 840
TTGTCAGTCA ATTGGCCTCA AGTCAACATT ATTTATTAGT GCCCTGTAAA ATATTCATTC 900
TTTTAATTAA AATTCTCAAA GGGCAGCTTA ACTGATTTTT TTTTTCAACA CATATTTAAA 960
CATAAGGTTT TAATAACTAA TTTCTAATAA ATAATAAATT TAGTTTGTCT TTGCCTTGAA 1020
GA 1022