EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33478 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:41800389-41801657 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr3:41800522-41800534AATGTAACATTT-6.52
EOMESMA0800.1chr3:41801522-41801535AAGGTGTGAATAG+6.17
Lhx3MA0135.1chr3:41800461-41800474AAATTAATTAAAT+6.07
NFYBMA0502.1chr3:41800732-41800747ATTTCAGCCAATCAG+6.09
TBX21MA0690.1chr3:41801522-41801532AAGGTGTGAA+6.02
TBX2MA0688.1chr3:41801522-41801533AAGGTGTGAAT+6.02
Enhancer Sequence
TTCAGTTTAA AAATAGTAGA TAAAATTAAA GCAAGCAAAC ATTAAAACTT AAAGTTATGA 60
TGAAAATAAA TGAAATTAAT TAAATAACAT ATAAACAACA AAACCACAGT TTGAAGCTTG 120
ATTTCAATCT TAAAATGTAA CATTTTGTGT GTCTTCACAA ACATATCTGA AAGTAATTGA 180
ATGGCGTGTC TCTCCTGAGG GCGAGTTAAG AGCAGAGAAA GTGATCAGTT GGTGATTCAC 240
TGATGGATGC AAATAAGGAT GCAAATAAGC AGGAAAATCA GTTGAACTCA GATTTCTCAG 300
GACGTTTCTC AGCAACGTTT TTTTTCCCAC TCTTAGCATT TTAATTTCAG CCAATCAGCT 360
TACAATTCCA ACAGAGCTGC GTGACTGGAC AGCAATTAAC ACTCAACTGT TATGCGTTAA 420
AACCAACTGC TTCTCTCCTC AGGGTTTCGG TTTTCTCGTT TATATCTTCA ACCGACACAA 480
CAAACTGAAC CTCCTTTAAA AGAAGTTACT CTTGTTAGCT TTGACTACAA CACTCCTGCC 540
ATTTAACACA ATACCGGTCG CTTTTCATGC AGTTGTTCAT TCTTGAGGAA TTTTGGGGTA 600
TTCAGAAGCA GCGTTGTGCA CTAATGTGGG TTATACCTTG TTAACTTTCC CTTGTCACTG 660
TGCTGTGGTG GGAAAGAACA CTGAGGTATA TAAATCGCAA CAGTGAGGGG GAATAAAGCT 720
GACAAAATGG GTAAGAAAAG GGCGTAAGGC TAGGAATAAG CAGCTTTAGA TGTTTCTGAA 780
TGGTGTGAGT ATTAAAGAAG GCCAATGGGT GGAGTTTGAG AAGTTAACTG ACAATCAAAG 840
GCAGCACTGA AGGAATCCCC ACACTGCACT TCCATAAAGG AGAGGGAACA ACAGGATTGA 900
GCCATTCACA CTGGACTGCT CCGTCCTGCT GGTGGAGGAC GATGCTCAAA AGAGCCAGTG 960
GGGTGTGAGG AATGAGTATG CAGATCTGCT GAATGCAGCT GCCCTGCGCT ATGGCTCTCA 1020
GGAATCTGTC CTGTCATGGA GATTCACAGC CTTGTCCATC AAGAAGGAGC GTAAGGGGAT 1080
TTACACACTA GAGACAGATC TGATTGAGCT CTTGATGGAT AGGATGAGTT TTGAAGGTGT 1140
GAATAGAACT GAATAGACAA GCTCCACCCT TCTTGGTTAC CGTTGCTAGA ACTTGCTTCA 1200
CAGAACAGAT TATGGAAGTC ATACACATTT TCAGCCCAGG CTCCTTGGAA ATATGTGACT 1260
CAACCTAC 1268