EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33474 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:41763076-41764728 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:41764043-41764054AAGCAATAAAA+6.32
ESX1MA0644.1chr3:41763711-41763721GTTAATTGGT-6.02
GFI1MA0038.2chr3:41764417-41764429TGCTGTGATTTC-6.22
Gfi1bMA0483.1chr3:41764417-41764428TGCTGTGATTT-6.62
HOXD9MA0913.2chr3:41764045-41764055GCAATAAAAC+6.02
Nr2f6MA0677.1chr3:41763870-41763884TGGGTCAAAGGTGA+6.03
POU1F1MA0784.1chr3:41763949-41763963GTTATGCAAATGAA+6.15
POU2F2MA0507.1chr3:41763950-41763963TTATGCAAATGAA-6.67
POU3F1MA0786.1chr3:41763950-41763962TTATGCAAATGA+6.52
POU3F2MA0787.1chr3:41763950-41763962TTATGCAAATGA+6.52
RXRBMA0855.1chr3:41763870-41763884TGGGTCAAAGGTGA+6.11
RXRGMA0856.1chr3:41763870-41763884TGGGTCAAAGGTGA+6.16
Enhancer Sequence
TCTTTAACAA GCAACCAGTT ACTCTTCCTC ACATGTGAAA AAAGTACATT ACATAATGTA 60
TTACCCACAA AACTGTAAAT CAGACTAGCA AGTCACACAC TAATTCCTCT GATGTCTGTA 120
ATATTATTTT CTCAGAGCTC TGTTGAACCA AGGATTACTG CTGAAGCTGG CAAATCACAC 180
GTTATCTACC CTAAGTCCGA TGAGACCGAA AATTTAGGAC AAGTGAGCTC ATCAGCCAGC 240
CCTATCAGTC CGTGCTATTT TTCCCACGTC TCACGCCTCT CCCTCGGTGG GTGAACCGCG 300
ATTAGCATCA CACGCACACA AAGAGAGTCT CAGCGTTTTC CCAGCGCACT CACTGTCTCC 360
TGCTCAGCAC TTTGTGCTGC TTCCCCGTGA GATTCTCACA CTGCAGCGCT CTCTGTCATC 420
CTACCCCTCC ACAGACGTTT TGCCTACAGT TTCGCTTCCC AATAGTTTCC TTGTCCCACA 480
TTGGAGGATG ACGTCCCCTG TGACCACACA GATACTTCAC ATCACAAAGC CTGTCCGAAA 540
CTTAACATCG CTGACACAAG ACAAAAACAA GAGGACATTG GCAAAAAAAG GAACACAACA 600
AACAAACTAA ATCAAGCTCT CTGGGTCTTG ACTGTGTTAA TTGGTACTGT CCCGGGACGC 660
TGTTCTCACT TCTCTTCCAA ATCCACCGCA TGTCCTCACA TAAACTGCAA CCTCAATTAA 720
TCTAAAGTGG ATGTTCTGTG TCTCACAGGG CTGTAAGGCA GTCATTCATT AGCAGGTTCT 780
CAGGATAACA GGCCTGGGTC AAAGGTGAAG TTATGATGGG ACGAGAGTGG AAATGGGGGA 840
AGGCTGGAAG TAGGACACGA GTGGGGGTCA GCAGTTATGC AAATGAACCG GTCTAGATAA 900
CAGGACAGTA CAGACAGCAA TTAGCACAAT AGAGCAGTCT CGGTTATTAC TCTAGTTTTT 960
ATGAACTAAG CAATAAAACA GGACCACTGA AAAACACACA GACTGCTTTC CTCTGGAGAT 1020
CTGCAGTTTT GGAAACTCTA GGCTGAAACT GGGCAACATG TGGTTCTTGT TAGGGAGGAC 1080
AAATAGACAG GAAAACAAAC AGATCAAGAA TTCATTTTGG AGCTTGTTGC AGTTAATGAG 1140
AGTCTACAGG GGTTTTGTGT TTGAAGTTGT CGACCACTTA GCGGTGTTGA GGCTTTTGAC 1200
ACTTTGGGCA ATGACTTTCG CACTTGCAGG TATGACTGGT GTGGCCTTCA TCATCAATCT 1260
GAAACAGTGT TTTATGGTGT TTAACTTACA CACTTCCATG TCACAACGGC TTTGTGCATC 1320
AAATTCACAT CCTAAAGCCT GTGCTGTGAT TTCACACCCA ACTGTTGATA CACACCAGCT 1380
GAGAGCTGTC AGCTGAGAGA CGTGTTATCA TGGGGGAAAA CAAGGGAATG AAAAGAACTA 1440
TGATTTTGAT CGCTATCTTT ATGTTATAGT ACAACACCGC AAAGTATGAA CACCTTGCTT 1500
TGTGCACTTT CTCACAGTTC ATCCCATAAC AATAATGTAT TATGATGCAT CCAGGTCATG 1560
ACGAATAAAG TGAATTTAAG AGTTGAATAC ACATCACAAA GTCCTTATTA TGATGGGGGA 1620
AACTCATAAT TTTTGAGATG GGGGCATCTC AG 1652