EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33432 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40648684-40650017 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF5MA0599.1chr3:40649187-40649197GCCCCGCCCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr3:40648943-40648954TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
POU1F1MA0784.1chr3:40648719-40648733AATATGTAAATTAG+7.28
POU2F1MA0785.1chr3:40648719-40648731AATATGTAAATT+6.02
POU3F1MA0786.1chr3:40648720-40648732ATATGTAAATTA+6.02
POU3F2MA0787.1chr3:40648720-40648732ATATGTAAATTA+6.02
POU3F3MA0788.1chr3:40648719-40648732AATATGTAAATTA+6.22
PROP1MA0715.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
TTTATATTGT ACATATTTAG CATTAACATT ACTAGAATAT GTAAATTAGA GAACATGCCA 60
CAAAGAAAAA TATATTTTAT TATCTTTGAT ATCAATAAAC TTAATGTGAT GTACTGTGTT 120
GCTCGAAACT CTTTAAAGTT TACATTATTC TTTTAAGTGA ATAAGACCAC CAACTGTACG 180
ATTAATCTGG AAAATGCCAA CCCTAACACA GAAAAATTTT TTTTAATTGC TTAAAAACTT 240
CATATCTCCT TAAAGGCCTT TAATTAAATT AATTACACAT AATACGTAGC CCGTGAGGTG 300
TACTGCACTA TAATTTAACC ATTTAGGCTA CATGACAGAA GACGTGTACT TACCATGCAG 360
AGATGAAAAC CGGAATCGAA AGCATACATT ACATCAACGT CAATATGTTT CCGTGAACCA 420
ATGAAAGACT TGTAGGCGGA GCGACATGTT CAGTCCCGCC TACTTATGGG CGGGGTTGAA 480
TATGCAGCCC CGCTCCGTAT TCAGCCCCGC CCCGATCTGC GGGCTGCAGA CGGGTGTACT 540
TGCCGCTATC GGCAAAGCAC GCTTAAAATT TACACATGAT ATCTATAAAT AAACCACAGA 600
TTTGAGTTTG TAAGAACTAC ATTCTCGCAT GAAACACTGT TAAAATTTCA TTTCGTGACA 660
TATTAAACGC AATATTTATA ATATTAGCTG GGCTTTCTCA TCCGCCATTA CCATTTGCTT 720
ATTGATGTGA AATGAATTCT GGGAGAAAAA AAATAAAAAT ATTAATTCTC AAAACACTTC 780
AAACGAACTT TATTTCTTAT TGTCAAGGTC AGATATATGT AATAATCTCG CTGGTAAAGT 840
GAATAAAAAA CAATGTTACT ATATTGTGAT CAATATCACG TTTGCACTGG TTCGGTTCAG 900
CACTCGAGCG ACTCGTATTG AACCGAATTG AACCGTTTGC TCGGGAACTA TTTGATCACA 960
CGTGTTCACA AGCACATTCA GCAATATGCA TTTAGTGTAT AATTAGTGTA TAAATGCGTG 1020
TGGCCAAGCA GTATAACGAA ATAGTAATGA ATCATATACA AAAAGGAATC AATTTTAGGC 1080
GGATTCGATT CTTTACTGTT CACTAAGTAG CCGATTTATA GAACCGAACG GACACGACTC 1140
GACATGCAGG CAACGTCATT AACTTATTGT AACTTAACTG CATTAATGAA TTCTCTATTT 1200
CAGCACAACA CTGAAATGAA GGCGAAGTCA CCATGAAAAG TTAAACGTTT ACCGTTAAGG 1260
TAAGCTCTGG TCTTCACATA ATCATTTTGA CTAAGCTATC ATTATGGTAA CATTTTTCAA 1320
CTGTAAGTTA GTT 1333