EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33411 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40423549-40424583 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:40424572-40424583GTTTTAATTAA+6.14
NFYAMA0060.3chr3:40424164-40424175TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr3:40424165-40424180CTGATTGGCTGAGCT-6.15
Enhancer Sequence
TCACTGCATT CAAATTATGT TTAAACTAGA AAATCCAAAC AGACAGAAAT CCAATAAGTC 60
TACAAACTCC AGTAATGAAA AATCGCAATG AGCATGGAGG AAAGTCCCGT GTGACCAAAA 120
CTTCCACTGA TTCTTTGCAT CAAAGCAGTA GTTTTATCTC AAAATGTGTT TTGCTTTTCA 180
TTACTGGAGA GTGCACGCTT ATTCAATTCT TCTTTAAAAG ATAAAATATA TAAGCTGTTA 240
AAAAAATATT GAAGCATATT TTCTAATCCA AATTTGTGGA TTACATCCTA ATATGCTGAA 300
CTATAATCTT CAAATGGTTT TAAATACTTT TCACTGTAAA TCATCTGAAC AGCAACGTTC 360
TGTATCAGTT TCTGAAGTCC TATATGTTTT GTGACTGCTT TTGTGGATGT CTAACAGAGC 420
TTGCAAAGTC AAAAACAGCC ACCGCATTTG CACAGGAACA ACTGTTTTGC TTACTCTGTC 480
GACGTGTGAA GTCTCCAGTG CCCGGGGAGG TAAATGGGCT GCTGAAATTA GAAATTACTC 540
ATCACGGAGA GCACAAAGGA GCTCTGTAAT GCTGGCTCTG ATGGTAGGGG GAGGGGCCTC 600
GTGAGGCAGT GTCTGTCTGA TTGGCTGAGC TCCAGAGAGG GGTGTGTGCG TGTCAAGGAT 660
GTGGGCGCTG GAGGAGTCTG CATCTGTTCA GAGTTATGCC AGCTCACATA CTGACGCAGT 720
GCTGCAGCAT GCCATCAAAA TGTCTGGCAC TGCATGTCGT CGTCTTCTTC TCGCAATGTA 780
AAACCTCTCC AAATATTTCC ATGCACACAT CTGCTGTTTG GAGAGCGAGT GAGCTGAATG 840
TGCCGTTGCT ATGCTGCGTG GCTTCAGGCA TCTGCAAAGT CAGCCTCAAA TCACCAGTCA 900
TGCCCACCCC GCTCAAAAAC ACAAAAGACT CTGTTTGGAT CAGAATGAAC ACTGCGCACA 960
GCAGGGAACA CAGAGTTGCT GTGCTTACTT ATTATGTTTG TTTTTCTCAG TGTGTTTACA 1020
GAGGTTTTAA TTAA 1034