EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33410 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40417646-40419382 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr3:40419067-40419079CCAATCACTGCA+6.44
NKX2-5MA0063.2chr3:40418506-40418516CTCAAGTGGT-6.02
POU4F1MA0790.1chr3:40418485-40418499ATAAATTATTAATT+6.14
RXRBMA0855.1chr3:40418181-40418195CGACCTTTCACCCC-6.06
SOX13MA1120.1chr3:40418356-40418367TGCCATTGTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr3:40418358-40418368CCATTGTTTT+6.02
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ZNF384MA1125.1chr3:40418555-40418567TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GCGATTATGA TGCTCGACAT CATCATGTAA TGTCTGAGAC TGTGTTGAGT CCGGACCCAT 60
TGAGGAAGGT TTGCATGTGC AGGTACAGAA GCCATCTCCC AACCGACTCG AGCAATCCCG 120
GTTCATGCGG TCAATGGCGA ACACTGCAGT CTCCCCTCCC TTCATTTCTG CAGCATGTCA 180
TCGTCTCGTC TCAGGGTCTG ACTGACCTAT ATCTGCCTCA TGCTCTCTGC CGCCTGCTGT 240
CTCAGAGCGT TTCTGTCTCT CTGTCATGCC CAGGAGCCCC TGCTGCAGAT GTAGGGCAGC 300
CCCGTCAGTT ATTCAGCACT TCACAGCACT GCAGTCCGGG TGGAGGGGCG AACCCAGCGC 360
CACCGGAGTG ATGAATTAAA CAGGACACTC TCTCACTCTC TCCCGCCCAC CTCTCTTGCT 420
TTGCTGCTTT TGGCTCAGGC AGTGCAACCG TTTTCCTGTC AGCTTGACAA TGGCGGGAGG 480
GAAGGAGGAC GGCGAGCACT TTAGCAGACT CGGGCCTCTA CGAAAAACAA GCCTGCGACC 540
TTTCACCCCA GCTGCTGGAG AGGTGGAGAG CTCCCTGGTG GTTTTGGGCA ATGGCCTTTT 600
GTTAGTCAGA GGAGGCTGTG GTGAAGGAGC TGCTGCTGGG AAGCTGTTTG CTGCTCAGAG 660
CCGAAACAAG TCAACACCAT TATTCACTTG TGAATTCCGT GCCGATTAAG TGCCATTGTT 720
TTTGACTGGT ATGACATTGT GGATTGTTTA GGACTTAATT AAATAAAGGT TATGTGTATA 780
AATCAGGGGC ATCATGAGGG TATTTTATGA TGCTTAAATG GATGGTTCAC CCAAAAATGA 840
TAAATTATTA ATTTAGGCTA CTCAAGTGGT TCTTGAAAAA ATCAAAGCAA GATGCAATGA 900
AAAATGTTGT AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGCC ATTGACATAT ATATAGCAAG 960
AGAAAATATT ACTATGGATT TCTATGCCTA AACATTTTTC AGTATACACT CACCGGCCAC 1020
TTTATTAGGT ACACCTTACT TGCGGGTTGG ACCCCCTTTC CCTTTAGAAC TGCCTTAATC 1080
CATGGCATAG ATTCAACAAG GTACTGGAAA TATTCCTTAG AGATTTTGGT CCAAGTTGAC 1140
ATGATAACAT CACACAGTTA CTGCAGATTT GTTAACTTTA GATCCAAGAT GTGAATCTCC 1200
AGTTCCAACA CATCCCAAAG GTGCTCTATT GGATTGAGCT CTGGTGACTG TGGAGGCCAT 1260
TTGAGTACAG TGAACTCATT GTCATGTTCA AGAAACCAGT CTGAGATGAT ACATGCTTTT 1320
ATTTAGGGTG CGTTATCCTG CTGGAAGTAG CCATCAGAAG ATGGGTACAC TGTGGTCATA 1380
AAGGGATGGA CATCAACAAG CAATTTGCAC ACATAGAACA GCCAATCACT GCATATTTTC 1440
TCTTTTACTG ACCACTCTTT GTAAACCCCA TAGATGGCTG TGTGTGAAAA TCCCAGTAGA 1500
TCAGTAGATT GGCACCAACG TTCAGAGACA CTGAAATAAT TTTTCTTCCC CATTCTGATG 1560
CTTGGTTTGA ACTGCAGTAG ATTGTCTTGA CCATGTCTAT ATGCCTGAAT GCATTGAGTT 1620
GCTGCCATGT GAAATTTGCA TTAACGAGAA CGTGTGGTGT TAAACCTTTA TGAGTTTCTT 1680
TCCTCCACTA AAGAACATAT TTTGTAGAAT GCTGCTTGTT GGGCCATATT GACATC 1736